当前蛋白身份：P28507
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BMM HUMAN ALPHA-THROMBIN COMPLEXED WITH [S-(R*,R*)]-4-[(AMINOIMINOMETHYL)AMINO]-N-[[1-[3-HYDROXY-2-[(2-NAPHTHALENYLSULFONYL)AMINO]-1-OXOPROPYL]-2-PYRROLIDINYL] METHYL]BUTANAMIDE (BMS-186282) 提交 1995-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
54–65（12 aa）
|
未记录 | BM2 S-(R*,R*)]-4-[AMINOIMINOMETHYL)AMINO]-N-[[1-[3-HYDROXY -2-[(2-NAPHTHALENYLSULFONYL)AMINO]-1-OXOPROPYL]-2-PYRROLIDINYL] METHYL]BUTANAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1BMN HUMAN ALPHA-THROMBIN COMPLEXED WITH [S-(R*,R*)]-1-(AMINOIMINOMETHYL)-N-[[1-[N-[(2-NAPHTHALENYLSULFONYL)-L-SERYL]-PYRROLIDINYL]METHYL]-3-PIPERIDENECARBOXAMIDE (BMS-189090) 提交 1995-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
54–65（12 aa）
|
未记录 | BM9 [S-(R*,R*)]-1-(AMINOIMINOMETHYL)-N-[[1-[N-[(2-NAPHTHALENYLSULFONYL)-L-SERYL]-3-PYRROLIDINYL]METHYL]-3-PIPERIDENECARBOXA MIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1DWE Crystallographic analysis at 3.0-Angstroms resolution of the binding to human thrombin of four active site-directed inhibitors 提交 1992-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
55–65（11 aa）
|
未记录 | 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1HDT STRUCTURE OF A RETRO-BINDING PEPTIDE INHIBITOR COMPLEXED WITH HUMAN ALPHA-THROMBIN 提交 1994-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
54–65（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0E7 methyl N-(4-carbamimidamidobutanoyl)-L-phenylalanyl-L-allothreonyl-L-phenylalaninate × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1T4U Crystal Structure Analysis of a novel Oxyguanidine bound to Thrombin 提交 2004-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
55–65（11 aa）
片段：sequence database residues 55-65
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 81A 2-METHANESULFONYL-BENZENESULFONIC ACID 3-METHYL-5-((1-AMIDINOAMINOOXYMETHYL-CYCLOPROPYL)METHYLOXY)-PHENYLESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1T4V Crystal Structure Analysis of a novel Oxyguanidine bound to Thrombin 提交 2004-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
55–65（11 aa）
片段：sequence database residues 55-65
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 14A N-ALLYL-5-AMIDINOAMINOOXY-PROPYLOXY-3-CHLORO-N-CYCLOPENTYLBENZAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1TOM ALPHA-THROMBIN COMPLEXED WITH HIRUGEN 提交 1996-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
55–64（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MIN METHYL-PHE-PRO-AMINO-CYCLOHEXYLGLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1VIT THROMBIN:HIRUDIN 51-65 COMPLEX 提交 1996-01-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
51–65（15 aa）
片段：RESIDUES 51 - 65
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP, RESERVOIRS CONTAINING 39% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.25 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 AND 1% PEG4000. DROPS CONSISTED OF EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND PROTEIN SOLUTION CONTAINING 23.5 MG/ML PROTEIN., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 3.20 Å |
| 1VIT THROMBIN:HIRUDIN 51-65 COMPLEX 提交 1996-01-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 J
51–65（15 aa）
片段：RESIDUES 51 - 65
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP, RESERVOIRS CONTAINING 39% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.25 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 AND 1% PEG4000. DROPS CONSISTED OF EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND PROTEIN SOLUTION CONTAINING 23.5 MG/ML PROTEIN., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 3.20 Å |
| 2JH0 Human Thrombin Hirugen Inhibitor complex 提交 2007-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
55–64（10 aa）
片段：RESIDUES 55-64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 701 (2R)-2-(5-CHLORO-2-THIENYL)-N-{(3S)-1-[(1S)-1-METHYL-2-MORPHOLIN-4-YL-2-OXOETHYL]-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL}PROPENE-1-SULFONAMIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；PH 6.80
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.210 |
| 2JH5 Human Thrombin Hirugen Inhibitor complex 提交 2007-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
55–64（10 aa）
片段：RESIDUES 55-64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 895 2-(5-CHLORO-2-THIENYL)-N-{(3S)-1-[(1S)-1-METHYL-2-MORPHOLIN-4-YL-2-OXOETHYL]-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL}ETHENESULFONAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；PH 6.80
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.231 |
| 2JH6 Human Thrombin Hirugen Inhibitor complex 提交 2007-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
55–64（10 aa）
片段：RESIDUES 55-64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 894 2-(5-CHLORO-2-THIENYL)-N-{(3S)-1-[(1S)-1-METHYL-2-MORPHOLIN-4-YL-2-OXOETHYL]-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL}ETHANESULFONAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；PH 6.80
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.196 |
| 2R2M 2-(2-Chloro-6-Fluorophenyl)Acetamides as Potent Thrombin Inhibitors 提交 2007-08-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
55–65（11 aa）
片段：unp residues 55-65
|
未记录 | I50 N-[2-({[amino(imino)methyl]amino}oxy)ethyl]-2-{6-chloro-3-[(2,2-difluoro-2-phenylethyl)amino]-2-fluorophenyl}acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.214 |
| 3C27 Cyanofluorophenylacetamides as Orally Efficacious Thrombin Inhibitors 提交 2008-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
55–65（11 aa）
片段：unp residues 55-65
|
未记录 | DKK N-[2-(carbamimidamidooxy)ethyl]-2-{6-cyano-3-[(2,2-difluoro-2-pyridin-2-ylethyl)amino]-2-fluorophenyl}acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.18 Å R-free 0.215 |