当前蛋白身份：P28511
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D6W STRUCTURE OF THROMBIN COMPLEXED WITH SELECTIVE NON-ELECTROPHILIC INHIBITORS HAVING CYCLOHEXYL MOIETIES AT P1 提交 1999-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
55–64（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 2 00R (5S)-N-[trans-4-(2-amino-1H-imidazol-5-yl)cyclohexyl]-1,3-dioxo-2-[2-(phenylsulfonyl)ethyl]-2,3,5,8-tetrahydro-1H-[1,2,4]triazolo[1,2-a]pyridazine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；24% PEG 8000, 0.1M Sodium Phosphate buffer,
Protein concentration: 3.5 mg/ml, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1O5G Dissecting and Designing Inhibitor Selectivity Determinants at the S1 site Using an Artificial Ala190 Protease (Ala190 uPA) 提交 2003-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
55–65（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 CR9 2-{5-[AMINO(IMINIO)METHYL]-6-FLUORO-1H-BENZIMIDAZOL-2-YL}-6-[(2-METHYLCYCLOHEXYL)OXY]BENZENOLATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；2-propanol, PEG 4000, pH 6.5, vapor diffusion at 298 K, pH 7.50
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.238 |
| 1Z71 thrombin and P2 pyridine N-oxide inhibitor complex structure 提交 2005-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
55–65（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | L17 L17 × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；peg8k, sodium phosphate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.254 |
| 1ZGI thrombin in complex with an oxazolopyridine inhibitor 21 提交 2005-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
55–64（10 aa）
片段：Hirugen
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 382 (R)-2-(2-(1H-1,2,4-TRIAZOL-1-YL)BENZYL)-N-(2,2-DIFLUORO-2-(PIPERIDIN-2-YL)ETHYL)OXAZOLO[4,5-C]PYRIDIN-4-AMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；PEK8K, Sodium Phosphate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.264 |
| 1ZGV Thrombin in complex with an oxazolopyridine inhibitor 2 提交 2005-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
55–64（10 aa）
片段：Hirugen
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 501 N7-BUTYL-N2-(5-CHLORO-2-METHYLPHENYL)-5-METHYL[1,2,4]TRIAZOLO[1,5-A]PYRIMIDINE-2,7-DIAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；PEK8K, Sodium phosphate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.228 |
| 2BDY thrombin in complex with inhibitor 提交 2005-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
55–64（10 aa）
片段：residues 55-64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 UNB N-(4-CARBAMIMIDOYL-BENZYL)-2-[2-HYDROXY-6-METHYL-3-(NAPHTHALENE-1-SULFONYLAMINO)-PHENYL]-ACETAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；27% PEG8000, 0.1M sodium phosphate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.225 |
| 3C1K Crystal structure of thrombin in complex with inhibitor 15 提交 2008-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
55–65（11 aa）
片段：UNP residues 55-65
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | T15 2-{3-[(benzylsulfonyl)amino]-6-methyl-2-oxopyridin-1(2H)-yl}-N-({1-[2-(tert-butylamino)-2-oxoethyl]-4-methyl-1H-imidazol-5-yl}methyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；PEK8K, Sodium phosphate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.84 Å |
| 5AHG Thrombin in complex with ((4-chlorophenyl)sulfamoyl))diemethylamine 提交 2015-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
54–65（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 Y4L ((4-Chlorophenyl)sulfamoyl))dimethylamine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；SEE MATERIAL AND METHODS SECTION OF PUBLICATION, pH 7.5
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.144 |