当前蛋白身份:P28799 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1G26 THE SOLUTION STRUCTURE OF A WELL-FOLDED PEPTIDE BASED ON THE 31-RESIDUE AMINO-TERMINAL SUBDOMAIN OF HUMAN GRANULIN A 提交 2000-10-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 281–311(31 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN (RESIDUES 1-31)
突变:D1V, K3H, S9I, Q20P 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;288 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 5;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM HGA 1-31 (D1V, K3H, S9I, Q20P); 20 mM sodium acetate-d3, 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
NMR样品组成 0.5 mM HGA 1-31 (D1V, K3H, S9I, Q20P); 20 mM sodium acetate-d3, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2JYE Human Granulin A 提交 2007-12-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 281–337(57 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2JYT Human Granulin C, isomer 1 提交 2007-12-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 364–417(54 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC1, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2JYU Human Granulin C, isomer 2 提交 2007-12-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 364–417(54 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC2, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2JYV Human Granulin F 提交 2007-12-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 123–179(57 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM [U-100% 15N] HgrnF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM [U-100% 15N] HgrnF, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6NUG hGRNA4-28_3s 提交 2019-02-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 284–307(24 aa) 片段:residues 284-307
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;290 K;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM hGRNA4-28_3s, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
8T8R Sortilin-PGRN peptide complex 提交 2023-06-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 578–593(16 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;20.00 %w/ PEG 3350, 0.20 M Sodium citrate
分辨率 2.87 Å R-free 0.287
8T8S Sortilin-PGRN peptide complex 提交 2023-06-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 578–593(16 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.10 M Tris, 30.00 %w/v PEG 3000, 0.20 M NaCl
分辨率 2.99 Å R-free 0.275
8T8S Sortilin-PGRN peptide complex 提交 2023-06-23 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 578–593(16 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.10 M Tris, 30.00 %w/v PEG 3000, 0.20 M NaCl
分辨率 2.99 Å R-free 0.275