当前蛋白身份:P28799
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1G26 THE SOLUTION STRUCTURE OF A WELL-FOLDED PEPTIDE BASED ON THE 31-RESIDUE AMINO-TERMINAL SUBDOMAIN OF HUMAN GRANULIN A 提交 2000-10-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
281–311(31 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN (RESIDUES 1-31)
|
突变:D1V, K3H, S9I, Q20P | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5;288 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 5;298 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM HGA 1-31 (D1V, K3H, S9I, Q20P); 20 mM sodium acetate-d3, 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
NMR样品组成
0.5 mM HGA 1-31 (D1V, K3H, S9I, Q20P); 20 mM sodium acetate-d3, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JYE Human Granulin A 提交 2007-12-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
281–337(57 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JYT Human Granulin C, isomer 1 提交 2007-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
364–417(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC1, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JYU Human Granulin C, isomer 2 提交 2007-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
364–417(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM HgrnC2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JYV Human Granulin F 提交 2007-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
123–179(57 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8;288 K;压力 ambient
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM [U-100% 15N] HgrnF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.2 mM EDTA, 0.5-1.0 mM [U-100% 15N] HgrnF, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6NUG hGRNA4-28_3s 提交 2019-02-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
284–307(24 aa)
片段:residues 284-307
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5;290 K;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM hGRNA4-28_3s, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8T8R Sortilin-PGRN peptide complex 提交 2023-06-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
578–593(16 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;20.00 %w/ PEG 3350, 0.20 M Sodium citrate
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.287 |
| 8T8S Sortilin-PGRN peptide complex 提交 2023-06-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
578–593(16 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.10 M Tris, 30.00 %w/v PEG 3000, 0.20 M NaCl
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.275 |
| 8T8S Sortilin-PGRN peptide complex 提交 2023-06-23 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
578–593(16 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.10 M Tris, 30.00 %w/v PEG 3000, 0.20 M NaCl
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.275 |