当前蛋白身份：P29350
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FPR CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN THE CATALYTIC DOMAIN OF SHP-1 AND AN IN VITRO PEPTIDE SUBSTRATE PY469 DERIVED FROM SHPS-1. 提交 2000-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
243–526（284 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
|
突变：C455S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |
| 1FPR CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN THE CATALYTIC DOMAIN OF SHP-1 AND AN IN VITRO PEPTIDE SUBSTRATE PY469 DERIVED FROM SHPS-1. 提交 2000-08-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
243–526（284 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
|
突变：C455S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |
| 1GWZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF THE PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE SHP-1 提交 1998-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–541（299 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
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分辨率 2.50 Å R-free 0.293 |
| 1X6C Solution structures of the SH2 domain of human protein-tyrosine phosphatase SHP-1 提交 2005-05-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–214（105 aa）
片段：SH2 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1mM SH2 domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2B3O Crystal structure of human tyrosine phosphatase SHP-1 提交 2005-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–532（532 aa）
片段：SHP-1
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 800, DTT, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 2RMX Solution structure of the SHP-1 C-terminal SH2 domain complexed with a tyrosine-phosphorylated peptide from NKG2A 提交 2007-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
110–214（105 aa）
片段：SH2 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient
NMR样品组成
0.8mM [U-13C; U-15N] SHP-1 C-terminal SH2 domain; 0.8mM tyrosine-phosphorylated peptide; 20mM [U-2H] TRIS; 100mM sodium chloride; 0.02% sodium azide; 1mM [U-2H] DTT; 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2YU7 Solution structure of the SHP-1 C-terminal SH2 domain complexed with a tyrosine-phosphorylated peptide from NKG2A 提交 2007-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
110–214（105 aa）
片段：SH2 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.89mM SHP1 SH2 domain U-15N,13C; 0.89mM NKG2A peptide; 20mM d-Tris-HCl (pH 7.4); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3PS5 Crystal structure of the full-length Human Protein Tyrosine Phosphatase SHP-1 提交 2010-11-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–595（595 aa）
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突变：C453S | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；2.5 ul of SHP-1 at 3.5 mg/ml in 25mM Tris-HCl, beta-mercaptoethanol, 1mM EDTA mixed with 2.5 ul of 1.8M ammonium sulfate, 0.1M glycine, 0.1M Tris-HCl, with the addition of 0.5 ul 14mM deoxy Big Chap to form the final drop., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.276 |
| 3PS5 Crystal structure of the full-length Human Protein Tyrosine Phosphatase SHP-1 提交 2010-11-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–595（595 aa）
|
突变：C453S | SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；2.5 ul of SHP-1 at 3.5 mg/ml in 25mM Tris-HCl, beta-mercaptoethanol, 1mM EDTA mixed with 2.5 ul of 1.8M ammonium sulfate, 0.1M glycine, 0.1M Tris-HCl, with the addition of 0.5 ul 14mM deoxy Big Chap to form the final drop., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.276 |
| 4GRY Crystal structure of SHP1 catalytic domain with SO4 提交 2012-08-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain UNP Residues 242-528
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突变：C453S | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.5 M ammonium sulfate, 3% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.231 |
| 4GRZ Crystal structure of SHP1 catalytic domain with PO4 提交 2012-08-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain UNP Residues 242-528
|
突变：C453S | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M ammonium phosphate, 12% PEG2000 , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.189 |
| 4GS0 Crystal structure of SHP1 catalytic domain with JAK1 activation loop peptide 提交 2012-08-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain (UNP Residues 242-528)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M calcium acetate, 13% PEG3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 4GS0 Crystal structure of SHP1 catalytic domain with JAK1 activation loop peptide 提交 2012-08-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain (UNP Residues 242-528)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M calcium acetate, 13% PEG3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 4HJP SHP-1 catalytic domain WPD loop open 提交 2012-10-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain (UNP Residues 242-528)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 1.0 M tri-sodium citrate, 2-4% 1-propanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.186 |
| 4HJQ SHP-1 catalytic domain WPD loop closed 提交 2012-10-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain (UNP Residues 242-528)
|
突变：C453S | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES pH7.5, 20 mM MgCl2, 28% sodium polyacrylate 5100 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 4HJQ SHP-1 catalytic domain WPD loop closed 提交 2012-10-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
243–528（286 aa）
片段：Phosphatase domain (UNP Residues 242-528)
|
突变：C453S | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES pH7.5, 20 mM MgCl2, 28% sodium polyacrylate 5100 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 6SM5 MbC/SHP1-C-SH2 complex 提交 2019-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
100–214（115 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium citrate tribasic, 0.1 M bistros propane 8.4 and 20 % PEG 3350
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分辨率 2.75 Å R-free 0.276 |
| 8YHI The Crystal Structure of SHP1 from Biortus. 提交 2024-02-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
243–528（286 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Hepes pH7.5, 2% PEG 400, 2.0M (NH4)2SO4
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分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |