当前蛋白身份:P31025 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1XKI Crystal structure of human tear lipocalin/von Ebners gland protein 提交 2004-09-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 23–176(154 aa)
突变:C101S, D158A ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;285 K;Tris/HCl, Zn-acetate, ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
分辨率 1.80 Å R-free 0.254
3EYC New crystal structure of human tear lipocalin in complex with 1,4-butanediol in space group P21 提交 2008-10-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 23–176(154 aa) 片段:residues 5-166
突变:C101S, D158A BU1 1,4-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;27% PEG3350, 0.8% 1.4-Butanediol, 200mM NaCl, 100mM Tris/HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
3EYC New crystal structure of human tear lipocalin in complex with 1,4-butanediol in space group P21 提交 2008-10-20 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 23–176(154 aa) 片段:residues 5-166
突变:C101S, D158A BU1 1,4-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;27% PEG3350, 0.8% 1.4-Butanediol, 200mM NaCl, 100mM Tris/HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
3EYC New crystal structure of human tear lipocalin in complex with 1,4-butanediol in space group P21 提交 2008-10-20 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 23–176(154 aa) 片段:residues 5-166
突变:C101S, D158A BU1 1,4-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;27% PEG3350, 0.8% 1.4-Butanediol, 200mM NaCl, 100mM Tris/HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
3EYC New crystal structure of human tear lipocalin in complex with 1,4-butanediol in space group P21 提交 2008-10-20 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 23–176(154 aa) 片段:residues 5-166
突变:C101S, D158A BU1 1,4-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;27% PEG3350, 0.8% 1.4-Butanediol, 200mM NaCl, 100mM Tris/HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.274
4QAF Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin) in complex with VEGF(8-109) 提交 2014-05-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 23–174(152 aa) 片段:UNP residues 23-174
链 B 23–174(152 aa) 片段:UNP residues 23-174
突变:;R26V,E27G,F28A,P29L,E30R,M31C,N32L,L33A,E34G,T37I,M39T,L56H,S58K,C61S,E69S,K76I,D80I,K83I,Y87K,I89G,C101S,E104C,H106S,K108V,R111P,K114W,C153S ; 突变:;R26V,E27G,F28A,P29L,E30R,M31C,N32L,L33A,E34G,T37I,M39T,L56H,S58K,C61S,E69S,K76I,D80I,K83I,Y87K,I89G,C101S,E104C,H106S,K108V,R111P,K114W,C153S ; OMA 10-{(1R,2R)-2-[(2E)-hex-2-en-1-yl]cyclopropyl}decanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.5;293 K;1 M sodium chloride, 0.2 M lithium sulfate, 7.5% w/v dextran sulfate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.242
5T43 NMR Structure of Apo-form Human Tear Lipocalin 提交 2016-08-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 19–176(158 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;310 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成 1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Lipocalin, 90 % H2O, 10 % D2O, 50 mM sodium phosphate, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供