当前蛋白身份:P31554 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4RHB Crystal structure of the lipopolysaccharide assembly complex LptD-LptE from the Escherichia coli outer membrane 提交 2014-10-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 203–784(582 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.35 Å R-free 0.338
4RHB Crystal structure of the lipopolysaccharide assembly complex LptD-LptE from the Escherichia coli outer membrane 提交 2014-10-01 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 203–784(582 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.35 Å R-free 0.338
9FZ5 Cryo-EM structure of LptDE-YedD complex from Escherichia Coli 提交 2024-07-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 26–784(759 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot 3-4 seconds
分辨率 3.57 Å
9I9Z LpDE from Escherichia coli 提交 2025-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–784(784 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9IA0 LpDE from Escherichia coli 提交 2025-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–784(784 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
9IA2 LpDEM from Escherichia coli 提交 2025-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–784(784 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.47 Å
9IA5 LpDEM from Escherichia coli 提交 2025-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–784(784 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9KN3 Cryo-EM structure of LptDEM complex from Escherichia coli 提交 2024-11-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–784(760 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 F 1–784(784 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9RPR Cryo-EM structure of LptDEM complex containing Shigella flexneri LptE and endogenous E. coli LptD and LptM 提交 2025-06-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–784(784 aa)
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 PXS (2S)-propane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;10mM HEPES, pH7.5, 100mM NaCl, 0.05% (w/v) DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9Y0P Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode I 提交 2025-08-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 26–37(12 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium acetate hydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.47 Å R-free 0.210
9Y0P Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode I 提交 2025-08-28 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 26–37(12 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium acetate hydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.47 Å R-free 0.210
9Y0Q Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode II 提交 2025-08-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 26–37(12 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Magnesium nitrate hexahydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.47 Å R-free 0.213