当前蛋白身份:P31554
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4RHB Crystal structure of the lipopolysaccharide assembly complex LptD-LptE from the Escherichia coli outer membrane 提交 2014-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
203–784(582 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.35 Å R-free 0.338 |
| 4RHB Crystal structure of the lipopolysaccharide assembly complex LptD-LptE from the Escherichia coli outer membrane 提交 2014-10-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
203–784(582 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.35 Å R-free 0.338 |
| 9FZ5 Cryo-EM structure of LptDE-YedD complex from Escherichia Coli 提交 2024-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
26–784(759 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot 3-4 seconds
|
分辨率 3.57 Å |
| 9I9Z LpDE from Escherichia coli 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–784(784 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9IA0 LpDE from Escherichia coli 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–784(784 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.62 Å |
| 9IA2 LpDEM from Escherichia coli 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–784(784 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å |
| 9IA5 LpDEM from Escherichia coli 提交 2025-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–784(784 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9KN3 Cryo-EM structure of LptDEM complex from Escherichia coli 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
25–784(760 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 F
1–784(784 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.10 Å |
| 9RPR Cryo-EM structure of LptDEM complex containing Shigella flexneri LptE and endogenous E. coli LptD and LptM 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–784(784 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 PXS (2S)-propane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;10mM HEPES, pH7.5, 100mM NaCl, 0.05% (w/v) DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.78 Å |
| 9Y0P Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode I 提交 2025-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
26–37(12 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium acetate hydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.210 |
| 9Y0P Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode I 提交 2025-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
26–37(12 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium acetate hydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.210 |
| 9Y0Q Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode II 提交 2025-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
26–37(12 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Magnesium nitrate hexahydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.213 |