当前蛋白身份:P32241
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1OF2 Crystal structure of HLA-B*2709 complexed with the vasoactive intestinal peptide type 1 receptor (VIPR) peptide (residues 400-408) 提交 2003-04-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:RESIDUES 400-408
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;TRIS PH 8.5, 19% PEG 8000 HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.244 |
| 1OGT CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*2705 COMPLEXED WITH THE VASOACTIVE INTESTINAL PEPTIDE TYPE 1 RECEPTOR (VIPR) PEPTIDE (RESIDUES 400-408) 提交 2003-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:RESIDUES 400-408
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;TRIS PH 8.0, 16% PEG 8000, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.178 |
| 3B3I Citrullination-dependent differential presentation of a self-peptide by HLA-B27 subtypes 提交 2007-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:RESIDUES 400-408
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris, 25% PEG 8000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.86 Å R-free 0.233 |
| 5IB1 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR measured at 295 K 提交 2016-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:UNP residues 400-408
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.192 |
| 5IB2 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR 提交 2016-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:UNP residues 400-408
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.161 |
| 5IB3 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR and Copper 提交 2016-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:UNP residues 400-408
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.204 |
| 5IB4 Crystal structure of HLA-B*27:05 complexed with the self-peptide pVIPR and Nickel 提交 2016-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:UNP residues 400-408
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.202 |
| 5IB5 Crystal structure of HLA-B*27:09 complexed with the self-peptide pVIPR and Copper 提交 2016-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
片段:UNP residues 400-408
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.272 |
| 5IB5 Crystal structure of HLA-B*27:09 complexed with the self-peptide pVIPR and Copper 提交 2016-02-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
400–408(9 aa)
片段:UNP residues 400-408
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.1 M Tris HCl, 16% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.272 |
| 7ALO Structure of B*27:09/photoRL9 提交 2020-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
400–408(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;291 K;20% (w/v) polyethylene glycol 3350, and 200 mM KSCN
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 7ALO Structure of B*27:09/photoRL9 提交 2020-10-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
400–408(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 7 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;291 K;20% (w/v) polyethylene glycol 3350, and 200 mM KSCN
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 8E3Y Cryo-EM structure of the VPAC1R-PACAP27-Gs complex 提交 2022-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
28–457(430 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.30 Å |
| 8E3Z Cryo-EM structure of the VPAC1R-VIP-Gs complex 提交 2022-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
28–457(430 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |