当前蛋白身份:P32790 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1SSH Crystal structure of the SH3 domain from a S. cerevisiae hypothetical 40.4 kDa protein in complex with a peptide 提交 2004-03-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 191–202(12 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;2.9M sodium malonate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 1.40 Å R-free 0.203
1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
链 B 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
链 B 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 357–413(57 aa) 片段:SH3 domain 3
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
2HBP Solution Structure of Sla1 Homology Domain 1 提交 2006-06-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 495–560(66 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7;298 K
NMR样品组成 0.5mM 15N, 13C labelled SHD1, 1mM unlabeled YNENPFSDPIK peptide. PBS buffer pH 6.7, 1mM d-DTT, 1mM NaN3 | 90% H2O, 10% D20
分辨率未提供
2JT4 Solution Structure of the Sla1 SH3-3-Ubiquitin Complex 提交 2007-07-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 350–420(71 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;318 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient
NMR样品组成 0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] SH3, 0.9 mM ubiquitin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] ubiquitin, 0.9 mM SH3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] SH3, 0.9 mM ubiquitin, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] ubiquitin, 0.9 mM SH3, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2V1Q Atomic-resolution structure of the yeast Sla1 SH3 domain 3 提交 2007-05-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 357–413(57 aa) 片段:SH3 DOMAIN 3, RESIDUES 357-413
未记录 NA SODIUM ION × 1 PT PLATINUM (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.20 Å R-free 0.188
2V1Q Atomic-resolution structure of the yeast Sla1 SH3 domain 3 提交 2007-05-29 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 357–413(57 aa) 片段:SH3 DOMAIN 3, RESIDUES 357-413
未记录 PT PLATINUM (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.20 Å R-free 0.188
3IDW Crystal structure of Sla1 homology domain 2 提交 2009-07-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 653–724(72 aa) 片段:Sla1 homology domain 2
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;277 K;0.1 M HEPES, 5% PEG-6000, 5% MPD, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.219
9HDB Sla1 SH3_3 domain (residues 355-414) 提交 2024-11-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 355–414(60 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;0.1M HEPES pH 7.5 20% PEG 10000 1mM peptide (PVSTPARTPARTPTP) dissolved in 0.03M HEPES pH 8, 0.15M NaCl, 0.5mM TCEP
分辨率 1.49 Å R-free 0.190
9HDB Sla1 SH3_3 domain (residues 355-414) 提交 2024-11-12 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 355–414(60 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;0.1M HEPES pH 7.5 20% PEG 10000 1mM peptide (PVSTPARTPARTPTP) dissolved in 0.03M HEPES pH 8, 0.15M NaCl, 0.5mM TCEP
分辨率 1.49 Å R-free 0.190