当前蛋白身份:P32790
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1SSH Crystal structure of the SH3 domain from a S. cerevisiae hypothetical 40.4 kDa protein in complex with a peptide 提交 2004-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
191–202(12 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;2.9M sodium malonate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.203 |
| 1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
链 B
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
链 B
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 1Z9Z Crystal structure of yeast sla1 SH3 domain 3 提交 2005-04-05 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
357–413(57 aa)
片段:SH3 domain 3
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;ammonium sulphate, sodium citrate, potassium/sodium tartrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 2HBP Solution Structure of Sla1 Homology Domain 1 提交 2006-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
495–560(66 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7;298 K
NMR样品组成
0.5mM 15N, 13C labelled SHD1,
1mM unlabeled YNENPFSDPIK peptide. PBS buffer pH 6.7, 1mM d-DTT, 1mM NaN3 | 90% H2O, 10% D20
|
分辨率未提供 |
| 2JT4 Solution Structure of the Sla1 SH3-3-Ubiquitin Complex 提交 2007-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
350–420(71 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6;318 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient
NMR样品组成
0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] SH3, 0.9 mM ubiquitin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] ubiquitin, 0.9 mM SH3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] SH3, 0.9 mM ubiquitin, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] ubiquitin, 0.9 mM SH3, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2V1Q Atomic-resolution structure of the yeast Sla1 SH3 domain 3 提交 2007-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
357–413(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN 3, RESIDUES 357-413
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 PT PLATINUM (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.20 Å R-free 0.188 |
| 2V1Q Atomic-resolution structure of the yeast Sla1 SH3 domain 3 提交 2007-05-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
357–413(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN 3, RESIDUES 357-413
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.20 Å R-free 0.188 |
| 3IDW Crystal structure of Sla1 homology domain 2 提交 2009-07-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
653–724(72 aa)
片段:Sla1 homology domain 2
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;277 K;0.1 M HEPES, 5% PEG-6000, 5% MPD, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 9HDB Sla1 SH3_3 domain (residues 355-414) 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
355–414(60 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;0.1M HEPES pH 7.5
20% PEG 10000
1mM peptide (PVSTPARTPARTPTP) dissolved in 0.03M HEPES pH 8, 0.15M NaCl, 0.5mM TCEP
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.190 |
| 9HDB Sla1 SH3_3 domain (residues 355-414) 提交 2024-11-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
355–414(60 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;0.1M HEPES pH 7.5
20% PEG 10000
1mM peptide (PVSTPARTPARTPTP) dissolved in 0.03M HEPES pH 8, 0.15M NaCl, 0.5mM TCEP
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.190 |