当前蛋白身份：P35194
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6KE6 3.4 angstrom cryo-EM structure of yeast 90S small subunit preribosome 提交 2019-07-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；wait 30s and blot 2s before plunging
|
分辨率 3.40 Å |
| 6LQP Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State A) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 70 PDB 声明：73-meric（73） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6LQQ Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State B) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 67 PDB 声明：70-meric（70） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6LQR Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State C) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.60 Å |
| 6LQS Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State D) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：79-meric（79） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6LQT Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State E) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 6LQU Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State A1) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric（72） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6LQV Cryo-EM structure of 90S small subunit preribosomes in transition states (State C1) 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6ZQB Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Saccharomyces cerevisiae, state B2 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6ZQC Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Saccharomyces cerevisiae, state Pre-A1 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6ZQD Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Saccharomyces cerevisiae, state Post-A1 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 63 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6ZQE Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Saccharomyces cerevisiae, state Dis-A (Poly-Ala) 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：62-meric（62） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7AJT Cryo-EM structure of the 90S-exosome super-complex (state Pre-A1-exosome) 提交 2020-09-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7AJU Cryo-EM structure of the 90S-exosome super-complex (state Post-A1-exosome) 提交 2020-09-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：78-meric（78） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7D4I Cryo-EM structure of 90S small ribosomal precursors complex with the DEAH-box RNA helicase Dhr1 (State F) 提交 2020-09-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7D5T Cryo-EM structure of 90S preribosome with inactive Utp24 (state F1) 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 7D63 Cryo-EM structure of 90S preribosome with inactive Utp24 (state C) 提交 2020-09-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 RP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 12.30 Å |
| 7SUK Structure of Bfr2-Lcp5 Complex Observed in the Small Subunit Processome Isolated from R2TP-depleted Yeast Cells 提交 2021-11-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 67 PDB 声明：70-meric（70） 与全部聚合物一致 |
链 SP
4–2421（2418 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9G33 Stalled 90S - Utp23-Krr1-deltaC3 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 UT
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 9N6V SSU processome maturation and disassembly, State A 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric（72） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 25 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9N6W SSU processome maturation and disassembly, State A* 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric（72） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 25 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 9N6X SSU processome maturation and disassembly, State B 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric（72） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 34 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 9N6Y SSU processome maturation and disassembly, State C 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 70 PDB 声明：73-meric（73） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 34 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 9N6Z SSU processome maturation and disassembly, State D 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric（72） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.74 Å |
| 9N70 SSU processome maturation and disassembly, State E 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric（72） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.17 Å |
| 9N72 SSU processome maturation and disassembly, State F 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 70 PDB 声明：73-meric（73） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.94 Å |
| 9N73 SSU processome maturation and disassembly, State G 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 71 PDB 声明：74-meric（74） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.96 Å |
| 9N74 SSU processome maturation and disassembly, State H 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 39 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9N75 SSU processome maturation and disassembly, State I 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 59 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9N76 SSU processome maturation and disassembly, State J 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：67-meric（67） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 38 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9N77 SSU processome maturation and disassembly, State K 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：64-meric（64） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 48 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.94 Å |
| 9N78 SSU processome maturation and disassembly, State L 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 47 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.17 Å |
| 9N79 SSU processome maturation and disassembly, State M 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric（45） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 47 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.93 Å |
| 9N7A SSU processome maturation and disassembly, State N 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric（39） 与全部聚合物一致 |
链 SP
1–2493（2493 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 47 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |