当前蛋白身份:P35221
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1H6G alpha-catenin M-domain 提交 2001-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
377–632(256 aa)
片段:M-FRAGMENT, RESIDUES 377-632
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6;30 % (V/V) MPD, 0.1 M SODIUM ACETETE BUFFER, PH 4.6, 20 MM CALCIUM CHLORIDE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 1H6G alpha-catenin M-domain 提交 2001-06-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
377–632(256 aa)
片段:M-FRAGMENT, RESIDUES 377-632
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6;30 % (V/V) MPD, 0.1 M SODIUM ACETETE BUFFER, PH 4.6, 20 MM CALCIUM CHLORIDE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 1L7C alpha-catenin fragment, residues 385-651 提交 2002-03-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
385–651(267 aa)
片段:Residues 385-651
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;293 K;sodium acetate, dithiothreitol, urea, sodium/potassium tartrate, isopropanol, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 1L7C alpha-catenin fragment, residues 385-651 提交 2002-03-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
385–651(267 aa)
片段:Residues 385-651
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;293 K;sodium acetate, dithiothreitol, urea, sodium/potassium tartrate, isopropanol, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 1L7C alpha-catenin fragment, residues 385-651 提交 2002-03-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
385–651(267 aa)
片段:Residues 385-651
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;293 K;sodium acetate, dithiothreitol, urea, sodium/potassium tartrate, isopropanol, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 1L7C alpha-catenin fragment, residues 385-651 提交 2002-03-14 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
385–651(267 aa)
片段:Residues 385-651
链 C
385–651(267 aa)
片段:Residues 385-651
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;293 K;sodium acetate, dithiothreitol, urea, sodium/potassium tartrate, isopropanol, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 4EHP Crystal Structure of human vinculin head domain (residues 1-252) in complex with alpha-catenin (residues 277-382) 提交 2012-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
277–382(106 aa)
片段:unp residues 277-382
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;PEG 3350, sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
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分辨率 2.66 Å R-free 0.229 |
| 4IGG Full-length human alpha-catenin crystal structure 提交 2012-12-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
82–906(825 aa)
片段:UNP residues 82-906
链 B
82–906(825 aa)
片段:UNP residues 82-906
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.8;295 K;0.9 M Na/K Phosphate, 0.3 M Na Malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 3.66 Å R-free 0.241 |
| 6UPV Alpha-E-catenin ABD-F-actin complex 提交 2019-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 L
1–906(906 aa)
链 M
1–906(906 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7UTJ Cryogenic electron microscopy 3D map of F-actin bound by human dimeric alpha-catenin 提交 2022-04-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 G
22–906(885 aa)
链 H
22–906(885 aa)
链 I
22–906(885 aa)
链 K
22–906(885 aa)
链 L
22–906(885 aa)
链 Z
22–906(885 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 9BL2 KIR3DL1*001 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
850–859(10 aa)
片段:residues 850-859 (Uniprot numbering)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;18% PEG-3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.231 |
| 9BL3 KIR3DL1*114 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
850–859(10 aa)
片段:residues 850-859 (Uniprot numbering)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 9BL4 KIR3DL1*086 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
850–859(10 aa)
片段:residues 850-859 (Uniprot numbering)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |