当前蛋白身份：P35414
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LOT AR55 solubilised in SDS micelles 提交 2012-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–55（55 aa）
片段：UNP residues 1-55
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；310 K
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] AR55, 96 mM [U-99% 2H] SDS, 20 mM sodium acetate, 1 mM sodium azide, 1 mM DSS, 10 mM [U-99% 2H] DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LOU AR55 solubilised in DPC micelles 提交 2012-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–55（55 aa）
片段：UNP residues 1-55
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4；310 K
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] AR55, 150 mM [U-99% 2H] DPC, 20 mM sodium acetate, 1 mM sodium azide, 1 mM DSS, 10 mM [U-99% 2H] DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LOV AR55 solubilised in LPPG micelles 提交 2012-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–55（55 aa）
片段：UNP residues 1-55
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；310 K
NMR样品组成
0.56 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] AR55, 72 mM LPPG, 20 mM [U-2H] sodium acetate, 1 mM sodium azide, 1 mM DSS, 10 mM [U-99% 2H] DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LOW Solution structure of AR55 in 50% HFIP 提交 2012-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–55（55 aa）
片段：UNP residues 1-55
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
310 K
NMR样品组成
.9 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] AR55, 50 % [U-99% 2H] hexafluoroisopropanol, 1 mM DSS, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 40 % H2O, 10 % [U-99% 2H] D2O, 50% Hexafluoroisopropanol/40% H2O /10% D2O | 50% Hexafluoroisopropanol/40% H2O /10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5VBL Structure of apelin receptor in complex with agonist peptide 提交 2017-03-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
7–229（223 aa）
片段：UNP residues 7-229, UNP residues 1-54, UNP residues 243-330
链 B
243–330（88 aa）
片段：UNP residues 7-229, UNP residues 1-54, UNP residues 243-330
|
突变：V117A, T177N,W261K, C325L, C326M 突变：V117A, T177N,W261K, C325L, C326M | ZN ZINC ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM MES pH 6.1, 26% PEG500 DME, 125mM MgCl2, 100mM NaCl, 500uM AMG3054
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 6KNM Apelin receptor in complex with single domain antibody 提交 2019-08-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
7–229（223 aa）
链 B
243–330（88 aa）
|
突变：V117A, T177N,W261K, C325L, C326M,V117A, T177N,W261K, C325L, C326M,V117A, T177N,W261K, C325L, C326M 突变：V117A, T177N,W261K, C325L, C326M,V117A, T177N,W261K, C325L, C326M,V117A, T177N,W261K, C325L, C326M | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES pH 6.1, 26% PEG500 DME, 125 mM MgCl2, 100 mM NaCl
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.305 |
| 7SUS Crystal structure of Apelin receptor in complex with small molecule 提交 2021-11-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
7–229（223 aa）
链 A
243–330（88 aa）
|
突变：V117A,E174C,T177N,M217C,I250C,C325L,C326M 突变：V117A,E174C,T177N,M217C,I250C,C325L,C326M | ZN ZINC ION × 1 8EH (1R,2S)-N-[4-(2,6-dimethoxyphenyl)-5-(6-methylpyridin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl]-1-(5-methylpyrimidin-2-yl)-1-oxidanyl-propane-2-sulfonamide × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES pH 6.1, 26% PEG500 DME, 125 mM MgCl2, 100 mM NaCl
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 7W0L Cryo-EM structure of a dimeric GPCR-Gi complex with small molecule 提交 2021-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 Q
2–330（329 aa）
链 R
2–330（329 aa）
|
未记录 | 8EH (1R,2S)-N-[4-(2,6-dimethoxyphenyl)-5-(6-methylpyridin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl]-1-(5-methylpyrimidin-2-yl)-1-oxidanyl-propane-2-sulfonamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 7W0M Cryo-EM structure of a monomeric GPCR-Gi complex with small molecule 提交 2021-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–330（329 aa）
|
未记录 | 8EH (1R,2S)-N-[4-(2,6-dimethoxyphenyl)-5-(6-methylpyridin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl]-1-(5-methylpyrimidin-2-yl)-1-oxidanyl-propane-2-sulfonamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 7W0N Cryo-EM structure of a dimeric GPCR-Gi complex with peptide 提交 2021-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 Q
2–330（329 aa）
链 R
2–330（329 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.21 Å |
| 7W0O Cryo-EM structure of a monomeric GPCR-Gi complex with peptide 提交 2021-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
2–330（329 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 7W0P Cryo-EM structure of a GPCR-Gi complex with peptide 提交 2021-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
2–330（329 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 8S4D Crystal structure of a peptidergic GPCR in complex with a small synthetic G protein-biased agonist 提交 2024-02-21 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
7–229（223 aa）
链 A
235–324（90 aa）
|
突变：T87V,N112A,T177N,T207M,F214L,I224A,S298A,C325L,C326M 突变：T87V,N112A,T177N,T207M,F214L,I224A,S298A,C325L,C326M | A1D5N (3~{S})-5-methyl-3-[[1-pentan-3-yl-2-(thiophen-2-ylmethyl)benzimidazol-5-yl]carbonylamino]hexanoic acid × 1 OLA OLEIC ACID × 6 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 4.75；293 K；25 to 35 % polyethylene glycol (PEG) 400, 100 mM sodium citrate, pH 4.75, and 150 mM of ammonium phosphate or ammonium acetate
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.275 |
| 8XQE Cryo-EM structure of human dimeric APJR-Gi complex with apelin-13. 提交 2024-01-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–330（330 aa）
链 R
1–330（330 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 8XQF Cryo-EM structure of human monomeric APJR-Gi complex with apelin-13. 提交 2024-01-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–330（330 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 8XQI Cryo-EM structure of human dimeric Apelin receptor. 提交 2024-01-05 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–330（330 aa）
链 B
1–330（330 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8XQJ Cryo-EM structure of human dimeric APJR complex with antagonistic antibody 提交 2024-01-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–330（330 aa）
链 D
1–330（330 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8XZF Cryo-EM structure of the WN561-bound human APLNR-Gi complex 提交 2024-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8XZG Cryo-EM structure of the [Pyr1]-apelin-13-bound human APLNR-Gi complex 提交 2024-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8XZH Cryo-EM structure of the MM07-bound human APLNR-Gi complex 提交 2024-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8XZI Cryo-EM structure of the CMF-019-bound human APLNR-Gi complex 提交 2024-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | A1D5N (3~{S})-5-methyl-3-[[1-pentan-3-yl-2-(thiophen-2-ylmethyl)benzimidazol-5-yl]carbonylamino]hexanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8XZJ Cryo-EM structure of the WN353-bound human APLNR-Gi complex 提交 2024-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8Z74 Cryo-EM structure of APJR complex with agonistic antibody 提交 2024-04-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–330（329 aa）
链 D
2–330（329 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8Z7J Cryo-EM structure of APJR-Gi complex with agonistic antibody 提交 2024-04-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
2–330（329 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9JH3 CMF-019 with APLNR-Gi complex 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | A1D5N (3~{S})-5-methyl-3-[[1-pentan-3-yl-2-(thiophen-2-ylmethyl)benzimidazol-5-yl]carbonylamino]hexanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å |
| 9LQT Cryo-EM structure of the Apo-state APLNR homodimer 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–380（380 aa）
链 B
1–380（380 aa）
|
未记录 | PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9LQU Cryo-EM structure of the JN241-9-bound state 1a of APLNR homodimer 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–380（380 aa）
链 B
1–380（380 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 16 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9LQW Cryo-EM structure of the JN241-9-bound state 1b of APLNR homodimer 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–380（380 aa）
链 B
1–380（380 aa）
|
未记录 | PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9LQX Cryo-EM structure of the JN241-9-bound state 1c of APLNR homodimer 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–380（380 aa）
链 B
1–380（380 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 16 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9LQY Cryo-EM structure of the AMG986-bound state 2a of APLNR homodimer 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–380（380 aa）
链 B
1–380（380 aa）
|
未记录 | PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 2 A1EK3 Azelaprag × 2 CLR CHOLESTEROL × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9LQZ Cryo-EM structure of the AMG986-bound state 2b of APLNR homodimer 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–380（380 aa）
链 B
1–380（380 aa）
|
未记录 | A1EK3 Azelaprag × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9LR1 Cryo-EM structure of the JN241-9-bound APLNR monomer-Gi complex 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9LR2 Cryo-EM structure of the JN241-9-bound APLNR dimer-Gi complex 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–380（380 aa）
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9LR3 Cryo-EM structure of the AMG986-bound APLNR monomer-Gi complex 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
1–380（380 aa）
|
未记录 | A1EK3 Azelaprag × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |