当前蛋白身份：P35659
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Q1V Structure of the Oncoprotein DEK: a putative DNA-binding Domain Related to the Winged Helix Motif 提交 2003-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
309–375（67 aa）
片段：RESIDUES 309-378
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.75；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NAPO4, 100mM KCL；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.0MM DEK C-TERMINAL DOMAIN
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分辨率未提供 |
| 2JX3 NMR solution structure of the N-terminal domain of DEK 提交 2007-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
78–208（131 aa）
片段：SAP domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM KCL；压力 ambient
NMR样品组成
0.65 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DEK78-208, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
链 L
1–375（375 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |
| 8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
链 L
1–375（375 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.69 Å |
| 9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
链 L
1–375（375 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |