当前蛋白身份:P35837
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3C9I Structure of P22 Tail-Needle GP26 Bound to Xenon Gas 提交 2008-02-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–233(233 aa)
链 B
1–233(233 aa)
链 C
1–233(233 aa)
|
突变:L222M 突变:L222M 突变:L222M | XE XENON × 7 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6;298 K;18% PEG 4000, 0.1M Ammonium Sulfate, 0.1M Ammonium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K, pH 4.60
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.269 |
| 3C9I Structure of P22 Tail-Needle GP26 Bound to Xenon Gas 提交 2008-02-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
1–233(233 aa)
链 E
1–233(233 aa)
链 F
1–233(233 aa)
|
突变:L222M 突变:L222M 突变:L222M | XE XENON × 7 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6;298 K;18% PEG 4000, 0.1M Ammonium Sulfate, 0.1M Ammonium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K, pH 4.60
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.269 |
| 4ZKP P22 Tail Needle Gp26 crystallized at pH 7.0 提交 2015-04-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–233(233 aa)
|
突变:L222M | CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;40% PEG 1000, 0.1M MOPS pH7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.189 |
| 4ZKP P22 Tail Needle Gp26 crystallized at pH 7.0 提交 2015-04-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–233(233 aa)
|
突变:L222M | CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;40% PEG 1000, 0.1M MOPS pH7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.189 |
| 4ZKU P22 Tail Needle Gp26 crystallized at pH 10.0 提交 2015-04-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–233(233 aa)
|
突变:L222M | CL CHLORIDE ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10;293 K;40% PEG 4000, 0.1M CAPS pH 10.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 4ZKU P22 Tail Needle Gp26 crystallized at pH 10.0 提交 2015-04-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–233(233 aa)
|
突变:L222M | CL CHLORIDE ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10;293 K;40% PEG 4000, 0.1M CAPS pH 10.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.225 |
| 4ZXQ P22 Tail Needle Gp26 1-140 crystallized at pH 3.9 提交 2015-05-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–140(140 aa)
链 B
1–140(140 aa)
链 C
1–140(140 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.9;293 K;20% PEG 8000, 0.05 M Potassium phosphate monobasic pH 3.9
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.252 |
| 4ZXQ P22 Tail Needle Gp26 1-140 crystallized at pH 3.9 提交 2015-05-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
1–140(140 aa)
链 E
1–140(140 aa)
链 F
1–140(140 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.9;293 K;20% PEG 8000, 0.05 M Potassium phosphate monobasic pH 3.9
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.252 |
| 8EAP Cryo-EM structure of the in-situ gp10-gp26 from bacteriophage P22 提交 2022-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 A
3–64(62 aa)
链 B
3–64(62 aa)
链 C
3–64(62 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |