当前蛋白身份:P38713 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4IAP Crystal structure of PH domain of Osh3 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2012-12-07 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 221–233(13 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
链 A 237–315(79 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
突变:D1020N, C1054T, C1097A 突变:D1020N, C1054T, C1097A SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;0.1M Tris-HCl, 15% PEG8000, 0.2 M Li2SO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.274
4IAP Crystal structure of PH domain of Osh3 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2012-12-07 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 221–233(13 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
链 B 237–315(79 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
突变:D1020N, C1054T, C1097A 突变:D1020N, C1054T, C1097A SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;0.1M Tris-HCl, 15% PEG8000, 0.2 M Li2SO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.274
4IAP Crystal structure of PH domain of Osh3 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2012-12-07 Assembly 3 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 221–233(13 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
链 A 237–315(79 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
链 B 221–233(13 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
链 B 237–315(79 aa) 片段:PH domain (UNP residues 221-317), T4 Lysozyme (UNP residues 2-161),PH domain (UNP residues 237-315)
突变:D1020N, C1054T, C1097A 突变:D1020N, C1054T, C1097A 突变:D1020N, C1054T, C1097A 突变:D1020N, C1054T, C1097A SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;0.1M Tris-HCl, 15% PEG8000, 0.2 M Li2SO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.274
4IC4 Crystal structure of Osh3 ORD from Saccharomyces cerevisiae 提交 2012-12-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 605–996(392 aa) 片段:ORD (OSBP related domain), UNP residues 605-996
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;0.1M MES-NaOH pH 6.0, 25% PEG1500, 0.1M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.234
4INQ Crystal structure of Osh3 ORD in complex with PI(4)P from Saccharomyces cerevisiae 提交 2013-01-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 605–996(392 aa) 片段:ORD (OSBP related domain), UNP residues 605-996
未记录 PIF (2R)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propane-1,2-diyl dioctanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;0.1M MES-NaOH, 25% polyethyleneglycol(PEG) 1500, 0.1M MgCl2, 0.5mM PI(4)P, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.280