当前蛋白身份：P39116
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BN8 BACILLUS SUBTILIS PECTATE LYASE 提交 1998-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；TYPE II CRYSTALS: 35 - 45 % 2-METHYL-2,4-PENTANDIOL 50 MM MOPS / 50 MM ETHANOLAMINE PH IN THE RANGE 6.50 TO 8.75
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分辨率 1.80 Å |
| 2BSP BACILLUS SUBTILIS PECTATE LYASE R279K MUTANT 提交 1998-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–420（420 aa）
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突变：R279K | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；30 % PEG 4000 0.2 M AMMONIUM SULPHATE 0.1 M SODIUM ACETATE AT PH 4.6
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分辨率 1.80 Å R-free 0.225 |
| 2NZM Hexasaccharide I bound to Bacillus subtilis pectate lyase 提交 2006-11-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：R279A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium citrate, 0.2M Ammonium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.185 |
| 2O04 Pectate lyase bound to hexasaccharide compound II 提交 2006-11-27 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：R279A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.2M Ammonium acetate, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.201 |
| 2O0V Pectate lyase bound to hexasaccharide compound III 提交 2006-11-28 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：R279A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.2M Ammonium acetate, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.199 |
| 2O0W Pectate lyase bound to hexasaccharide compound IV 提交 2006-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：R279A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.2M Ammonium acetate, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.198 |
| 2O17 Pectate lyase bound to hexasaccharide 提交 2006-11-28 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：R279A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.2M Ammonium acetate, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 2O1D Pectate lyase bound to trisaccharide 提交 2006-11-28 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：R279A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.2M Ammonium acetate, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 3KRG Structural insights into substrate specificity and the anti beta-elimination mechanism of pectate lyase 提交 2009-11-18 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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突变：D173A,N180A,K247A | CO COBALT (II) ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 50% PEG, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 5AMV Structural insights into the loss of catalytic competence in pectate lyase at low pH 提交 2015-09-02 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；19% PEG 4K, 0.1M SODIUM ACETATE PH4, 0.2M AMMONIUM ACETATE
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分辨率 1.57 Å R-free 0.193 |
| 5X2I Polygalacturonate Lyase by Fusing with a Self-assembling Amphipathic Peptide 提交 2017-01-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–420（399 aa）
片段：UNP residues 22-420
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium bromide, 20 mM Glycine-NaOH, 20 % polyethylene glycol 3350, 7 mM calcium chloride, 20 % glycerol
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分辨率 2.05 Å R-free 0.200 |