当前蛋白身份：P41065
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 M
1–73（73 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
|
分辨率 3.81 Å R-free 0.262 |
| 5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 N
1–73（73 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
|
分辨率 3.81 Å R-free 0.262 |
| 6N57 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation I 提交 2018-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 M
2–73（72 aa）
|
未记录 | 1N7 CHAPSO × 4 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6N58 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation II 提交 2018-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 M
2–73（72 aa）
|
未记录 | 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 6PSQ Escherichia coli RNA polymerase closed complex (TRPc) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6PSR Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6PSS Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1.5a) with TraR and mutant rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6PST Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1.5b) with TraR and mutant rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6PSU Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi2) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6PSV Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TpreRPo) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6PSW Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPo) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 N
2–73（72 aa）
|
未记录 | 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |