当前蛋白身份:P41697
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3OKQ Crystal structure of a core domain of yeast actin nucleation cofactor Bud6 提交 2010-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
549–688(140 aa)
片段:coiled-coil domain (unp residues 549-688)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;12% PEG 3350, 175 mM sodium malonate (pH 7.0), 20% glycerol, 5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.227 |
| 3ONX Crystal structure of a domain of a protein involved in formation of actin cytoskeleton 提交 2010-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
549–688(140 aa)
片段:coiled-coil domain (unp residues 549-688)
链 B
549–688(140 aa)
片段:coiled-coil domain (unp residues 549-688)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;9% PEG 3350, 85 mM sodium malonate (pH 7.0), 25% glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.278 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
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分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 T
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 V
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 Y
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 F
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 J
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 L
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 N
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 P
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |
| 4WYB Structure of the Bud6 flank domain in complex with actin 提交 2014-11-17 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 R
699–788(90 aa)
片段:residues 699-788
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;3.5M sodium formate, 0.1M CaCl2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.258 |