当前蛋白身份:P42166
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差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GJJ N-TERMINAL CONSTANT REGION OF THE NUCLEAR ENVELOPE PROTEIN LAP2 提交 2001-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–168(168 aa)
片段:N-TERMINAL CONSTANT REGION (RESIDUES 1-168)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM SODIUM PHOSPHATE
|
分辨率未提供 |
| 1H9F LEM DOMAIN OF HUMAN INNER NUCLEAR MEMBRANE PROTEIN LAP2 提交 2001-03-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
103–159(57 aa)
片段:LEM DOMAIN (103-159)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
|
分辨率未提供 |
| 8FN7 Structure of WT HIV-1 intasome bound to Dolutegravir 提交 2022-12-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8FND Structure of E138K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8FNG Structure of G140A HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 8FNH Structure of Q148K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8FNL Structure of E138K/Q148K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8FNN Structure of E138K/G140A/Q148K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8FNP Structure of E138K/G140S/Q148H HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 8FNQ Structure of E138K/G140A/Q148K HIV-1 intasome with 4d bound 提交 2022-12-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
50–100(51 aa)
链 B
50–100(51 aa)
链 C
50–100(51 aa)
链 D
50–100(51 aa)
链 G
50–100(51 aa)
链 H
50–100(51 aa)
链 I
50–100(51 aa)
链 J
50–100(51 aa)
|
突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K | OZ1 4-amino-N-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-1-hydroxy-6-(6-hydroxyhexyl)-2-oxo-1,2-dihydro-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |