当前蛋白身份:P42166 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1GJJ N-TERMINAL CONSTANT REGION OF THE NUCLEAR ENVELOPE PROTEIN LAP2 提交 2001-06-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–168(168 aa) 片段:N-TERMINAL CONSTANT REGION (RESIDUES 1-168)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM SODIUM PHOSPHATE
分辨率未提供
1H9F LEM DOMAIN OF HUMAN INNER NUCLEAR MEMBRANE PROTEIN LAP2 提交 2001-03-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 103–159(57 aa) 片段:LEM DOMAIN (103-159)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
分辨率未提供
8FN7 Structure of WT HIV-1 intasome bound to Dolutegravir 提交 2022-12-27 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8FND Structure of E138K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K 突变:E138K MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8FNG Structure of G140A HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A 突变:G140A MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8FNH Structure of Q148K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K 突变:Q148K MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8FNL Structure of E138K/Q148K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K 突变:E138K,Q148K MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8FNN Structure of E138K/G140A/Q148K HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-27 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8FNP Structure of E138K/G140S/Q148H HIV-1 intasome with Dolutegravir bound 提交 2022-12-28 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H 突变:E138K,G140S,Q148H MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8FNQ Structure of E138K/G140A/Q148K HIV-1 intasome with 4d bound 提交 2022-12-28 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 50–100(51 aa)
链 B 50–100(51 aa)
链 C 50–100(51 aa)
链 D 50–100(51 aa)
链 G 50–100(51 aa)
链 H 50–100(51 aa)
链 I 50–100(51 aa)
链 J 50–100(51 aa)
突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K 突变:E138K,G140A,Q148K OZ1 4-amino-N-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-1-hydroxy-6-(6-hydroxyhexyl)-2-oxo-1,2-dihydro-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å