当前蛋白身份:P42566 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1C07 STRUCTURE OF THE THIRD EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15 提交 1999-07-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 217–311(95 aa) 片段:EPS15 HOMOLOGY (EH) DOMAIN 3
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM KCL, 2mM CACL2, 2mM NAN3;压力 AMBIENT
NMR样品组成 0.5-1MM EH3; 20MM D-TRIS, 100MM KCL, 2MM CACL2, 2MM NAN3, 0.1MM D-DTT; 95% H2O, 5% D2O
分辨率未提供
1EH2 STRUCTURE OF THE SECOND EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-07-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 121–218(98 aa) 片段:EPS15 HOMOLOGY (EH) DOMAIN 2, RESIDUES 121-218
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120 MILLIMOLAR;压力 ATMOSPHERIC
NMR样品组成 H2O AND D2O
分辨率未提供
1F8H STRUCTURE OF THE SECOND EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15 IN COMPLEX WITH PTGSSSTNPFR 提交 2000-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 121–215(95 aa) 片段:RESIDUES 121-218 OF HUMAN EPS15
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide, 20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride, 1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide 2 mM calcium chloride | 10%/90% D2O/H2O
NMR样品组成 1 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide, 20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride, 1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide 2 mM calcium chloride | 99.999% D2O
NMR样品组成 0.2 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide, 20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride, 1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide 2 mM calcium chloride | 10%/90% D2O/H2O
NMR样品组成 0.2 mM {15N}-EH2 and 5 mM peptide, 20 mM perdeuterated Tris, 100 mM potassium chloride, 1 mM perdeuterated DTT, 1 mM sodium azide 2 mM calcium chloride | 10%/90% D2O/H2O
分辨率未提供
1FF1 STRUCTURE OF THE SECOND EPS15 HOMOLOGY DOMAIN OF HUMAN EPS15 IN COMPLEX WITH PTGSSSTNPFL 提交 2000-07-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 121–215(95 aa) 片段:SECOND EH DOMAIN
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1 MM {15N}-EH2 AND 5 MM PEPTIDE, 20 MM PERDEUTERATED TRIS, 100 MM POTASSIUM CHLORIDE, 1 MM PERDEUTERATED DTT, 1 MM SODIUM AZIDE, 2 MM CALCIUM CHLORIDE | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 MM {15N}-EH2 AND 5 MM PEPTIDE, 20 MM PERDEUTERATED TRIS, 100 MM POTASSIUM CHLORIDE, 1 MM PERDEUTERATED DTT, 1 MM SODIUM AZIDE, 2 MM CALCIUM CHLORIDE | 100% D2O
分辨率未提供
2JXC Structure of the EPS15-EH2 Stonin2 Complex 提交 2007-11-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 121–215(95 aa) 片段:EH 2 domain
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;295 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] EH2, 0.5-1 mM Stonin peptide, 2 mM CA, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.5-1 mM EH2, 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Stonin peptide, 2 mM CA, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] EH2, 0.5-1 mM Stonin peptide, 2 mM CA, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.5-1 mM EH2, 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Stonin peptide, 2 mM CA, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.6 mM EH2, 0.6 mM Stonin peptide, 2 mM CA, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
4RH5 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 846–854(9 aa) 片段:PTYR849 peptide (UNP RESIDUES 846-854)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.203
4RH9 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) H812F, M883G mutant in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 846–854(9 aa) 片段:pTyr849 peptide (UNP RESIDUES 846-854)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.226
4RHG Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) D811E, C842S mutant in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 846–854(9 aa) 片段:pTyr849 peptide (UNP RESIDUES 846-854)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.209
4S0G Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with Eps15 pTyr849 P850V peptide 提交 2014-12-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 846–854(9 aa) 片段:Phosphotyrosine 849 peptide, UNP residues 846-854
突变:P850V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 26% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.72 Å R-free 0.229
5JP2 Fcho1 Mu homology domain (Danio Rerio) with bound Eps15 peptide 提交 2016-05-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 615–637(23 aa) 片段:UNP Residues 615-637
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;289 K;100 mM Bis-Tris propane pH, 6.0, 200 mM sodium citrate, 22% PEG 3350 and 10 mM DTT Crystals were cryopretetcted in 22% glycerol before flash cooling
分辨率 2.40 Å R-free 0.234
5JP2 Fcho1 Mu homology domain (Danio Rerio) with bound Eps15 peptide 提交 2016-05-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 615–637(23 aa) 片段:UNP Residues 615-637
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;289 K;100 mM Bis-Tris propane pH, 6.0, 200 mM sodium citrate, 22% PEG 3350 and 10 mM DTT Crystals were cryopretetcted in 22% glycerol before flash cooling
分辨率 2.40 Å R-free 0.234