当前蛋白身份:P43146 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2ED7 Solution structure of the first fibronectin type III domain of human Netrin receptor DCC 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 419–524(106 aa) 片段:first fn3 domain, Fibronectin type-III 1
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.3mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O, 90% H2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2ED8 Solution structure of the second fibronectin type III domain of human Netrin receptor DCC 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 528–620(93 aa) 片段:second fn3 domain, Fibronectin type-III 2
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.2mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O, 90% H2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2ED9 Solution structure of the third fibronectin type III domain of human Netrin receptor DCC 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 602–718(117 aa) 片段:third fn3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O' | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2EDB Solution structure of the fourth fibronectin type III domain of human Netrin receptor DCC 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 716–818(103 aa) 片段:fourth fn3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.2mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O' | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2EDD Solution structure of the fifth fibronectin type III domain of human Netrin receptor DCC 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 833–942(110 aa) 片段:fifth fn3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.2mM sample U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2EDE Solution structure of the sixth fibronectin type III domain of human Netrin receptor DCC 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 944–1044(101 aa) 片段:sixth fn3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.3mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3AU4 Structure of the human myosin-X MyTH4-FERM cassette bound to its specific cargo, DCC 提交 2011-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1390–1447(58 aa) 片段:P3 domain, UNP residues 1390-1447
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100mM maric acid-MES-Tris (MMT) buffer, 2% PEG 1500, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.233
4URT The crystal structure of a fragment of netrin-1 in complex with FN5- FN6 of DCC 提交 2014-07-02 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 844–1043(200 aa) 片段:FN5-FN6, RESIDUES 844-1043
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 18 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;0.1M MES PH 6.0, 0.15M AMMONIUM SULFATE AND 15% (W/V) PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.265
5X83 Structure of DCC FN456 domains 提交 2017-02-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 721–815(95 aa) 片段:UNP residues 721-815
链 B 844–1043(200 aa) 片段:UNP residues 844-1043
链 C 721–815(95 aa) 片段:UNP residues 721-815
链 D 844–1043(200 aa) 片段:UNP residues 844-1043
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;291 K;0.1M Sodium Phosphate Monobasic Monohydrate, 0.1M Potassium Phosphate Monobasic, 0.1M MES Monohydrate pH 6.5, 2.0M Sodium Chloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.278