当前蛋白身份:P43558 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3BY4 Structure of Ovarian Tumor (OTU) domain in complex with Ubiquitin 提交 2008-01-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 91–301(211 aa) 片段:Otu domain
未记录 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;Bis-Tris, Magnesium Chloride, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.211
3C0R Structure of Ovarian Tumor (OTU) domain in complex with Ubiquitin 提交 2008-01-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 91–301(211 aa) 片段:Otu domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 6.5;277 K;MES, ammonium acetate, PEG3350, pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.31 Å R-free 0.243
3C0R Structure of Ovarian Tumor (OTU) domain in complex with Ubiquitin 提交 2008-01-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 91–301(211 aa) 片段:Otu domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 6.5;277 K;MES, ammonium acetate, PEG3350, pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.31 Å R-free 0.243
4KDI Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–73(73 aa) 片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;20% PEG 2000, 10% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.86 Å R-free 0.257
4KDI Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–73(73 aa) 片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;20% PEG 2000, 10% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.86 Å R-free 0.257
4KDL Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–73(73 aa) 片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;14% PEG 4000, 0.1 M Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.81 Å R-free 0.213
4KDL Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–73(73 aa) 片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;14% PEG 4000, 0.1 M Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.81 Å R-free 0.213