当前蛋白身份:P43558
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3BY4 Structure of Ovarian Tumor (OTU) domain in complex with Ubiquitin 提交 2008-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
91–301(211 aa)
片段:Otu domain
|
未记录 | 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;Bis-Tris, Magnesium Chloride, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.211 |
| 3C0R Structure of Ovarian Tumor (OTU) domain in complex with Ubiquitin 提交 2008-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
91–301(211 aa)
片段:Otu domain
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 6.5;277 K;MES, ammonium acetate, PEG3350, pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.243 |
| 3C0R Structure of Ovarian Tumor (OTU) domain in complex with Ubiquitin 提交 2008-01-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
91–301(211 aa)
片段:Otu domain
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 6.5;277 K;MES, ammonium acetate, PEG3350, pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.243 |
| 4KDI Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–73(73 aa)
片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;20% PEG 2000, 10% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.257 |
| 4KDI Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
1–73(73 aa)
片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;20% PEG 2000, 10% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.257 |
| 4KDL Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–73(73 aa)
片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;14% PEG 4000, 0.1 M Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.213 |
| 4KDL Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL 提交 2013-04-25 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–73(73 aa)
片段:UBX-like domain (Residues 1-73)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;295 K;14% PEG 4000, 0.1 M Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.213 |