当前蛋白身份:P44859
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BWZ DIAMINOPIMELATE EPIMERASE FROM HEMOPHILUS INFLUENZAE 提交 1998-09-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–274(274 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
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分辨率 2.72 Å R-free 0.242 |
| 1GQZ Refinement of Haemophilus influenzae Diaminopimelate epimerase at 1.7A 提交 2001-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–274(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.1M IMIDIZOLE PH 6.5,
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分辨率 1.75 Å R-free 0.196 |
| 2GKE Crystal structure of diaminopimelate epimerase in complex with an irreversible inhibitor LL-AziDAP 提交 2006-04-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–274(274 aa)
|
未记录 | ZDP (2S,6S)-2,6-DIAMINO-2-METHYLHEPTANEDIOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACY ACETIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2.8 M sodium acetate and 0.1 M HEPES (pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.35 Å R-free 0.168 |
| 2GKJ Crystal structure of diaminopimelate epimerase in complex with an irreversible inhibitor DL-AZIDAP 提交 2006-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–274(274 aa)
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未记录 | ZDR (2R,6S)-2,6-DIAMINO-2-METHYLHEPTANEDIOIC ACID × 1 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2.8 M sodium acetate and 0.1 M HEPES (pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.210 |
| 2Q9H Crystal structure of the C73S mutant of diaminopimelate epimerase 提交 2007-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–274(274 aa)
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突变:C73S | TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.8 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.2 M NaCl, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 2Q9J Crystal structure of the C217S mutant of diaminopimelate epimerase 提交 2007-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–274(274 aa)
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突变:C217S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;(0.8 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.2 M NaCl, 0.1M HEPES), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.253 |