当前蛋白身份:P47992 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1J8I Solution Structure of Human Lymphotactin 提交 2001-05-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 22–114(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;283 K;离子强度(mmCIF原始值)200 mM sodium chloride
NMR样品组成 1.3mM Human Lymphotactin, U-15N,13C; 20 mM phosphate buffer pH 6.0, 200 mM NaCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM Human Lymphotactin, U-15N; 20 mM phosphate buffer pH 6.0, 200 mM NaCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM Human Lymphotactin, 20 mM phosphate buffer pH 6.0, 200 mM NaCl | 100% D2O
分辨率未提供
1J9O SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN LYMPHOTACTIN 提交 2001-05-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 22–114(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;283 K;离子强度(mmCIF原始值)200mM NaCl
NMR样品组成 1.3mM human lymphotactin U-15N-13C; 20 mM phosphate buffer, 200mM NaCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM human lymphotactin U-15N; 20 mM phosphate buffer, 200mM NaCl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM human lymphotactin; 20 mM phosphate buffer, 200mM NaCl | 100% D2O
分辨率未提供
2HDM Solution structure of V21C/V59C Lymphotactin/XCL1 提交 2006-06-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 23–114(92 aa)
突变:V21C, V59C 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1 mM CC3 hLtn, U-15N, 13C; 20 mM phospate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JP1 Solution structure of the alternative conformation of XCL1/Lymphotactin 提交 2007-04-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 22–114(93 aa)
链 B 22–114(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;313 K;离子强度(mmCIF原始值)22;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1.0 mM XCL1 U-15N/13C, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.6 mM XCL1 U-15N/13C, 0.6 mM XCL1 unlabeled, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2N54 Solution structure of a disulfide stabilized XCL1 dimer 提交 2015-07-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 22–114(93 aa)
链 B 22–114(93 aa)
突变:A57C, A70C 突变:A57C, A70C 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;313 K;离子强度(mmCIF原始值)0.02;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] XCL1, 20 mM potassium phosphate, 0.02 % [U-100% 15N] sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2NYZ Viral Chemokine Binding Protein M3 From Murine Gammaherpesvirus68 In Complex With The C- Chemokine XCL1 提交 2006-11-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 22–114(93 aa)
链 E 22–114(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;10% PEG 8000, 100 mM TRIS, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
9AST Cryo-EM structure of XCR1 signaling complex 提交 2024-02-26 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 L 22–114(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å