当前蛋白身份:P48432 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1GT0 Crystal structure of a POU/HMG/DNA ternary complex 提交 2002-01-09 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 D 41–120(80 aa) 片段:HMG DOMAIN RESIDUES 41-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;18% PEG3350, 50 MM HEPES PH 7.0, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
6HT5 Oct4/Sox2:UTF1 structure 提交 2018-10-03 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 D 41–120(80 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;100 mM 4-morpholineethanesulfonic acid at pH 6.0, 33% v/v 2-methyl-2,4-pentanediol
分辨率 3.45 Å R-free 0.248
8BX1 Oct4/Sox2 protein:DNA complex 提交 2022-12-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 E 41–120(80 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;277 K;0.1M sodium acetate, 12% (v/v) PEG 4000
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
8BX2 Oct4/Sox2 protein:DNA complex 提交 2022-12-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 E 41–120(80 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M HEPES, 70% (v/v) MPD
分辨率 3.14 Å R-free 0.252