当前蛋白身份：P49023
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2O9V The second SH3 domain from Ponsin in complex with the paxillin proline rich region 提交 2006-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
45–54（10 aa）
片段：Proline rich region
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；0.2M Sodium Acetate, 0.1M Sodium Cacodylate, 30% (w/v) PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.177 |
| 2VZD Crystal structure of the C-terminal calponin homology domain of alpha parvin in complex with paxillin LD1 motif 提交 2008-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–20（20 aa）
片段：PAXILLIN LD1 MOTIF, RESIDUES 1-20
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；20% (W/V) PEG 10000, 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.255 |
| 2VZD Crystal structure of the C-terminal calponin homology domain of alpha parvin in complex with paxillin LD1 motif 提交 2008-07-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–20（20 aa）
片段：PAXILLIN LD1 MOTIF, RESIDUES 1-20
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；20% (W/V) PEG 10000, 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.255 |
| 2VZG Crystal structure of the C-terminal calponin homology domain of alpha- parvin in complex with paxillin LD2 motif 提交 2008-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
8–27（20 aa）
片段：PAXILLIN LD1 MOTIF, RESIDUES 141-160
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；286 K；40% (W/V) PEG200, 0.1 M CITRATE PH 4.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 2VZI Crystal structure of the C-terminal calponin homology domain of alpha- parvin in complex with paxillin LD4 motif 提交 2008-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
262–277（16 aa）
片段：;PAXILLIN LD4 MOTIF, RESIDUES 262-277 AND 312-315 OF PAXILLIN ISOFORM BETA,PAXILLIN LD4 MOTIF, RESIDUES 262-277 AND 312-315 OF PAXILLIN ISOFORM BETA
;
链 A
312–315（4 aa）
片段：;PAXILLIN LD4 MOTIF, RESIDUES 262-277 AND 312-315 OF PAXILLIN ISOFORM BETA,PAXILLIN LD4 MOTIF, RESIDUES 262-277 AND 312-315 OF PAXILLIN ISOFORM BETA
;
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；286 K；40%(W/V) PEG 300, 0.1M CITRATE PH 5.2
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.260 |
| 3GM1 Crystal Structure of the Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain of Pyk2 in Complex with Paxillin LD4 Motif-Derived Peptides 提交 2009-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
262–274（13 aa）
片段：Paxillin LD4 Motif, UNP residues 262-274
链 F
262–274（13 aa）
片段：Paxillin LD4 Motif, UNP residues 262-274
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；4.1 M NaCl, 100 mM HEPES, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.290 |
| 3GM1 Crystal Structure of the Focal Adhesion Targeting (FAT) Domain of Pyk2 in Complex with Paxillin LD4 Motif-Derived Peptides 提交 2009-03-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
262–274（13 aa）
片段：Paxillin LD4 Motif, UNP residues 262-274
链 D
262–274（13 aa）
片段：Paxillin LD4 Motif, UNP residues 262-274
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；4.1 M NaCl, 100 mM HEPES, 5% glycerol, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.290 |
| 3PY7 Crystal structure of full-length Bovine Papillomavirus oncoprotein E6 in complex with LD1 motif of paxillin at 2.3A resolution 提交 2010-12-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–10（10 aa）
|
突变：D108A,K109A,K265A,E385A,K388A,D389A (maltose-binding periplasmic protein) | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；290 K；1.6 M ammonium sulfate, 2% PEG2000 MME 0.1 M HEPES sodium, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.225 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
261–277（17 aa）
片段：unp residues 261-277
链 I
261–277（17 aa）
片段：unp residues 261-277
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
261–277（17 aa）
片段：unp residues 261-277
链 J
261–277（17 aa）
片段：unp residues 261-277
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
261–277（17 aa）
片段：unp residues 261-277
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 3U3F Structural basis for the interaction of Pyk2 PAT domain with paxillin LD motifs 提交 2011-10-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
261–277（17 aa）
片段：unp residues 261-277
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；291.2 K；The 4 ul drop contained 2 ul protein-LD4 peptide mixture (20mM Mes, pH6.2, 1mM protein, 2 mM peptide) and 2 ul ML (100 mM MES pH6.3, 4.2 M NaCl, 2%(v/v) glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.2K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.266 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 4EDN Crystal structure of beta-parvin CH2 domain in complex with paxillin LD1 motif 提交 2012-03-27 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–20（20 aa）
片段：LD1 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.1M Ammonium sulfate, 0.01M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 6U4M Solution structure of paxillin LIM4 提交 2019-08-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
527–591（65 aa）
片段：LIM4 domain residues 527-591
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
1.45 mM [U-13C; U-15N] Paxillin LIM4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6U4N Solution structure of paxillin LIM4 in complex with kindlin-2 F0 提交 2019-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
527–591（65 aa）
片段：LIM4 domain residues 527-591
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.55 mM U-15N, U-13C paxillin LIM4, 0.89 mM kindlin-2 F0, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.54 mM U-15N, U-13C kindlin-2 F0, 0.85 mM paxillin LIM4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.55 mM U-15N, U-13C paxillin LIM4, 0.89 mM kindlin-2 F0, 99.8% D2O | 99.8% D2O
NMR样品组成
0.54 mM U-15N, U-13C kindlin-2 F0, 0.85 mM paxillin LIM4, 99.8% D2O | 99.8% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7QB0 Solution structure of paxillin LIM2/3 提交 2021-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–499（120 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
500 uM [U-13C; U-15N] Paxillin LIM2/3, 150 mM sodium chloride, 50 mM sodium phosphate, 4 mM sodium azide, 1 mM DTT, 0.1 mM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
500 uM [U-13C; U-15N] Paxillin LIM2/3, 150 mM sodium chloride, 50 mM sodium phosphate, 4 mM sodium azide, 1 mM DTT, 0.1 mM DSS, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9QWO Vinculin tail bound to paxillin LD2 提交 2025-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
140–158（19 aa）
链 F
140–158（19 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；295 K；1.26 M (NH4)2SO4, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na Acetate pH4.5
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.259 |