当前蛋白身份:P49126 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2MI5 Structure of insect-specific sodium channel toxin mu-Dc1a 提交 2013-12-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 39–94(56 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.02;压力 ambient
NMR样品组成 350 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Dc1a-1, 20 mM sodium acetate-2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6A90 Complex of voltage-gated sodium channel NavPaS from American cockroach Periplaneta americana and Dc1a 提交 2018-07-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 39–94(56 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6A91 Complex of voltage-gated sodium channel NavPaS from American cockroach Periplaneta americana bound with saxitoxin and Dc1a 提交 2018-07-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 39–94(56 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 9SL [(3aS,4R,10aS)-2,6-diamino-10,10-dihydroxy-3a,4,9,10-tetrahydro-3H,8H-pyrrolo[1,2-c]purin-4-yl]methyl carbamate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6A95 Complex of voltage-gated sodium channel NavPaS from American cockroach Periplaneta americana bound with tetrodotoxin and Dc1a 提交 2018-07-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 39–94(56 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 9SR (1R,5R,6R,7R,9S,11S,12S,13S,14S)-3-amino-14-(hydroxymethyl)-8,10-dioxa-2,4-diazatetracyclo[7.3.1.1~7,11~.0~1,6~]tetradec-3-ene-5,9,12,13,14-pentol (non-preferred name) × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8F0S Structure of VSD4-NaV1.7-NaVPas channel chimera bound to the hybrid inhibitor GNE-9296 提交 2022-11-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 39–94(56 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X80 5-chloro-4-(cyclopentylmethoxy)-N-(4-{[(1S,2S)-2-(dimethylamino)cyclohexyl]amino}-2-fluorobenzene-1-sulfonyl)-2-fluorobenzamide × 1 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å