当前蛋白身份:P49281 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5F0L Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 545–568(24 aa) 片段:UNP residues 545-568
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.75 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 15% Glycerol
分辨率 3.20 Å R-free 0.259
5F0M Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 (SeMet labeled) 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 549–560(12 aa) 片段:UNP residues 549-560
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 5% Glycerol
分辨率 3.10 Å R-free 0.254
5F0P Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1(L557M) (SeMet labeled) 提交 2015-11-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 549–560(12 aa)
突变:L557M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 10% Glycerol
分辨率 2.78 Å R-free 0.261
9F6N Human divalent metal transporter 1 (DMT1/SLC11A2) in complex with manganese, in an occluded state 提交 2024-05-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–590(589 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9F6O Human divalent metal transporter 1 (DMT1/SLC11A2) in complex with sybody 1, in an occluded state 提交 2024-05-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–590(589 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å