当前蛋白身份:P49418 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1KY7 THE AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE IN COMPLEX WITH AMPHIPHYSIN FXDXF 提交 2002-02-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 P 322–330(9 aa) 片段:RESIDUES 322-330
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.15 Å R-free 0.252
1UTC Clathrin terminal domain complexed with TLPWDLWTT 提交 2003-12-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 P 379–387(9 aa) 片段:W-BOX, RESIDUES 379-387
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;VAPOUR DIFFUSION OVER A RESERVOIR CONTAINING 20% PEG8000, 200 MM MGCL2, 4 MM DTT,100 MM CAPS PH 9, DRIED UP DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
1UTC Clathrin terminal domain complexed with TLPWDLWTT 提交 2003-12-08 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 Q 379–387(9 aa) 片段:W-BOX, RESIDUES 379-387
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;VAPOUR DIFFUSION OVER A RESERVOIR CONTAINING 20% PEG8000, 200 MM MGCL2, 4 MM DTT,100 MM CAPS PH 9, DRIED UP DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
3SOG Crystal structure of the BAR domain of human Amphiphysin, isoform 1 提交 2011-06-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 34–236(203 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 K POTASSIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;277.15 K;2.66% PEG 6000, 2.66% PEG 8000, 2.66% PEG 10,000, 0.02M Magnesium Acetate, 0.05M Potassium Chloride, 0.1M MES, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
4ATM Crystal structure of the BAR domain of human Amphiphysin, isoform 1 at 1.8 Angstrom resolution featuring increased order at the N- terminus. 提交 2012-05-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–242(242 aa) 片段:RESIDUES 1-242
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;20% PEG 3350, 0.1 M CITRATE PH 5.5
分辨率 1.78 Å R-free 0.218
5M5S Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 349–358(10 aa) 片段:Clathrin-box motif, UNP residues 349-358
链 G 349–358(10 aa) 片段:Clathrin-box motif, UNP residues 349-358
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 2 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 0.85 M sodium malonate pH 7.5
分辨率 1.88 Å R-free 0.234
5M5S Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 349–358(10 aa) 片段:Clathrin-box motif, UNP residues 349-358
链 H 349–358(10 aa) 片段:Clathrin-box motif, UNP residues 349-358
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 2 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 0.85 M sodium malonate pH 7.5
分辨率 1.88 Å R-free 0.234
5M61 Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to an extended amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 349–360(12 aa) 片段:extended Clathrin-box motif, UNP residues 349-360
链 G 349–360(12 aa) 片段:extended Clathrin-box motif, UNP residues 349-360
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.1;293 K;1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL protein, 3.4 mM peptide) plus 2 uL of 1.04 M sodium malonate pH 7.1, 0.2 M sodium perchlorate equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.15 M sodium malonate pH 7.1
分辨率 1.84 Å R-free 0.182
5M61 Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to an extended amphiphysin clathrin-box motif 提交 2016-10-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 349–360(12 aa) 片段:extended Clathrin-box motif, UNP residues 349-360
链 H 349–360(12 aa) 片段:extended Clathrin-box motif, UNP residues 349-360
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.1;293 K;1 uL protein:peptide mix (14 mg/mL protein, 3.4 mM peptide) plus 2 uL of 1.04 M sodium malonate pH 7.1, 0.2 M sodium perchlorate equilibrated against a 200 uL reservoir of 1.15 M sodium malonate pH 7.1
分辨率 1.84 Å R-free 0.182