当前蛋白身份：P49591
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3VBB Crystal Structure of Seryl-tRNA Synthetase from Human at 2.9 angstroms 提交 2012-01-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–514（514 aa）
链 B
1–514（514 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate pH 7.0, 5mM ATP, 10mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.250 |
| 3VBB Crystal Structure of Seryl-tRNA Synthetase from Human at 2.9 angstroms 提交 2012-01-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–514（514 aa）
链 D
1–514（514 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate pH 7.0, 5mM ATP, 10mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.250 |
| 3VBB Crystal Structure of Seryl-tRNA Synthetase from Human at 2.9 angstroms 提交 2012-01-02 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–514（514 aa）
链 F
1–514（514 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate pH 7.0, 5mM ATP, 10mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.250 |
| 4L87 Crystal structure of the human seryl-tRNA synthetase in complex with Ser-SA at 2.9 Angstrom resolution 提交 2013-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–477（476 aa）
片段：UNP residues 2-477
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未记录 | SSA 5'-O-(N-(L-SERYL)-SULFAMOYL)ADENOSINE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium fluoride or ammonium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.90 Å R-free 0.268 |
| 4RQE human Seryl-tRNA synthetase dimer complexed with two molecules of tRNAsec 提交 2014-11-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–514（514 aa）
链 C
1–514（514 aa）
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突变：E156T, R157S 突变：E156T, R157S | SER SERINE × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；18%(m/v) PEG3350, 0.1M NaCl, 0.1M Tris-HCl (pH8.0), 0.1M Sodium malonate pH7.0. , VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.322 |
| 4RQF human Seryl-tRNA synthetase dimer complexed with one molecule of tRNAsec 提交 2014-11-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–514（514 aa）
链 B
1–514（514 aa）
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突变：E447K 突变：E447K | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 SER SERINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；18%(m/v) PEG3350, 0.1M NaCl, 0.1M Tris-HCl (pH8.0), 0.1M Sodium malonate pH7.0., VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.314 |
| 8P7B CryoEM structure of METTL6 tRNA SerRS complex in a 1:2:2 stoichiometry 提交 2023-05-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–514（514 aa）
链 D
1–514（514 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.42 Å |
| 8P7C CryoEM structure of METTL6 tRNA SerRS complex in a 2:2:2 stoichiometry 提交 2023-05-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–514（514 aa）
链 D
1–514（514 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8P7D CryoEM structure of METTL6 tRNA SerRS complex in a 1:1:2 stoichiometry 提交 2023-05-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–514（514 aa）
链 D
1–514（514 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.20 Å |
| 9DPD Cryo-EM structure of SerRS dimer in complex with one SIRT2 提交 2024-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–514（514 aa）
链 D
1–514（514 aa）
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未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.87 Å |
| 9DPI Cryo-EM structure of SerRS dimer in complex with two SIRT2 提交 2024-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–514（514 aa）
链 F
1–514（514 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；in 25mM HEPES-Na pH7.5, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.90 Å |