当前蛋白身份：P50281
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BQQ CRYSTAL STRUCTURE OF THE MT1-MMP--TIMP-2 COMPLEX 提交 1998-08-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
114–287（174 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.60
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.248 |
| 1BUV CRYSTAL STRUCTURE OF THE MT1-MMP-TIMP-2 COMPLEX 提交 1998-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
114–287（174 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.248 |
| 2MQS Transient Collagen Triple Helix Binding to a Key Metalloproteinase in Invasion and Development: Spin Labels to Structure 提交 2014-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
316–511（196 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 ambient
NMR样品组成
300 uM [U-13C; U-15N; U-2H] Hemopexin-like (HPX) of MT1-MMP, 10 mM Sodium acetate, 1 mM EDTA, 1 mM Sodium azide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.85 mM THP, 10 mM Sodium acetate, 1 mM EDTA, 1 mM Sodium azide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 3C7X Hemopexin-like domain of matrix metalloproteinase 14 提交 2008-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
316–511（196 aa）
片段：UNP residues 316-511
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；2.1M malic acid, 0.1M HCl, 40% acetone, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 3C7X Hemopexin-like domain of matrix metalloproteinase 14 提交 2008-02-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
316–511（196 aa）
片段：UNP residues 316-511
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；2.1M malic acid, 0.1M HCl, 40% acetone, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 3C7X Hemopexin-like domain of matrix metalloproteinase 14 提交 2008-02-08 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
316–511（196 aa）
片段：UNP residues 316-511
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；2.1M malic acid, 0.1M HCl, 40% acetone, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 3MA2 Complex membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) with tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2010-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
112–292（181 aa）
片段：Residues 112-292
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.247 |
| 3MA2 Complex membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) with tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2010-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
112–292（181 aa）
片段：Residues 112-292
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.247 |
| 3X23 Radixin complex 提交 2014-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
563–582（20 aa）
片段：cytoplasmic tail, UNP residues 563-582
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；12% polyethylene glycol 4000, 100mM MOPS (pH 7.0), 100mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.237 |
| 4P3C MT1-MMP:Fab complex (Form I) 提交 2014-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 M
215–227（13 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 ACT ACETATE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl.hexahydrate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.200 |
| 4P3D MT1-MMP:Fab complex (Form II) 提交 2014-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
215–227（13 aa）
片段：MT1-MMP V-B loop
链 M
215–227（13 aa）
片段：MT1-MMP V-B loop
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl.hexahydrate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.210 |
| 4QXU Novel Inhibition Mechanism of Membrane Metalloprotease by an Exosite-Swiveling Conformational antibody 提交 2014-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
218–228（11 aa）
片段：peptide (unp residues 218-228)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1M (NH4)2SO4, 0.01M MgCl2
0.05M MES, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.293 |
| 5H0U Crystal structure of the catalytic domain of membrane type 1 matrix metalloproteinase 提交 2016-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
116–285（170 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Ammonium nitrate, PEG3350
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分辨率 2.24 Å R-free 0.254 |
| 6CLZ MT1-MMP HPX domain with Blade 4 Loop Bound to Nanodiscs 提交 2018-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
316–511（196 aa）
片段：residues 316-511
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未记录 | PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 218 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 1
NMR样品组成
20 mM Tris-HCl, 300 mM NaCl, 0.02 % sodium azide, 93 % H2O, 7 % [U-100% 2H] D2O, 90 uM 2H, 13C, 15N MT1-MMP hemopexin-like domain, 180 uM MSP1D1, 14.4 mM PX4, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 6CM1 MT1-MMP HPX Domain with Blade 2 Loop Bound to Nanodiscs 提交 2018-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
316–511（196 aa）
片段：residues 316-511
|
未记录 | PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 218 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 1
NMR样品组成
20 mM Tri-HCl, 300 mM NaCl, 0.02 % sodium azide, 93 % H2O, 7 % [U-100% 2H] D2O, 90 uM 2H, 13C, 15N MT1-MMP hemopexin-like domain, 180 uM MSP1D1, 14.4 mM PX4, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |