当前蛋白身份:P51784 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4MEL Crystal Structure of the human USP11 DUSP-UBL domains 提交 2013-08-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 67–288(222 aa) 片段:DUSP-UBL domains, UNP residues 67-288
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES/imidazole, 30 mM Na Nitrate, 30 mM Na phosphate and 30 mM Na sulphate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.90 Å R-free 0.297
4MEL Crystal Structure of the human USP11 DUSP-UBL domains 提交 2013-08-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 67–288(222 aa) 片段:DUSP-UBL domains, UNP residues 67-288
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES/imidazole, 30 mM Na Nitrate, 30 mM Na phosphate and 30 mM Na sulphate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.90 Å R-free 0.297
4MEL Crystal Structure of the human USP11 DUSP-UBL domains 提交 2013-08-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 67–288(222 aa) 片段:DUSP-UBL domains, UNP residues 67-288
链 B 67–288(222 aa) 片段:DUSP-UBL domains, UNP residues 67-288
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES/imidazole, 30 mM Na Nitrate, 30 mM Na phosphate and 30 mM Na sulphate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.90 Å R-free 0.297
8OYP Crystal structure of Ubiquitin specific protease 11 (USP11) in complex with a substrate mimetic 提交 2023-05-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 295–489(195 aa)
链 A 778–937(160 aa)
突变:C318S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:C318S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293.15 K;100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 11.25% v/v MPD; 11.25% PEG 1000; 11.25% w/v PEG 3350 with 5 mM CdCl2
分辨率 2.44 Å R-free 0.235
8OYP Crystal structure of Ubiquitin specific protease 11 (USP11) in complex with a substrate mimetic 提交 2023-05-05 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 295–489(195 aa)
链 B 778–937(160 aa)
突变:C318S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:C318S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293.15 K;100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 11.25% v/v MPD; 11.25% PEG 1000; 11.25% w/v PEG 3350 with 5 mM CdCl2
分辨率 2.44 Å R-free 0.235