当前蛋白身份：P52490
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JAT Mms2/Ubc13 Ubiquitin Conjugating Enzyme Complex 提交 2001-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–153（152 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 1000, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.239 |
| 1JBB Ubiquitin Conjugating Enzyme, Ubc13 提交 2001-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–153（153 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 5000-MME, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.255 |
| 1JBB Ubiquitin Conjugating Enzyme, Ubc13 提交 2001-06-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–153（153 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 5000-MME, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.255 |
| 2GMI Mms2/Ubc13~Ubiquitin 提交 2006-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
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突变：C87S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；17% PEG 1000, 100 mM Na/K phosphate, pH 6.2, 25 mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 4FH1 S. cerevisiae Ubc13-N79A 提交 2012-06-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–153（153 aa）
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突变：N79A, C87S | NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.3；296 K；0.1 M CHES, pH 10.3, 20% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
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分辨率 2.61 Å R-free 0.246 |
| 5OJW S. cerevisiae UBC13 - MMs2 complex 提交 2017-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；0.1M Bis-Tris Propane / Citric Acid Buffer, pH 7.6, 20% PEG3000
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分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 6ZHS Uba1 bound to two E2 (Ubc13) molecules 提交 2020-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–153（153 aa）
链 C
1–153（153 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；273 K；ammonium sulfate, HEPES, PEG 3350
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分辨率 2.35 Å R-free 0.275 |
| 6ZHT Uba1-Ubc13 disulfide mediated complex 提交 2020-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–152（152 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 12 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；273 K；ammonium nitrate, CHES, PEG 4000
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分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 9GLT Crystal Structure of Yeast Ubc13 C87E 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
1–153（153 aa）
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突变：C87E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, 25% PEG 4000
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分辨率 1.45 Å R-free 0.228 |
| 9GLT Crystal Structure of Yeast Ubc13 C87E 提交 2024-08-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 BBB
1–153（153 aa）
|
突变：C87E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, 25% PEG 4000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.228 |