当前蛋白身份：P52735
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2DLZ Solution structure of the SH2 domain of human protein vav-2 提交 2006-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
663–767（105 aa）
片段：sh2 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.16mM 13C,15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2DM1 Solution structure of the second SH3 domain of human protein vav-2 提交 2006-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
819–878（60 aa）
片段：sh3 domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.07mM 13C,15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2LNW Identification and structural basis for a novel interaction between Vav2 and Arap3 提交 2012-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
659–771（113 aa）
片段：UNP RESIDUES 659-771
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 3 mM entity_2-2, 5 mM potassium phosphate-3, 20 mM sodium phosphate-4, 5 mM DTT-5, 2 mM EDTA-6, 75 mM sodium chloride-7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-8, 3 mM entity_2-9, 5 mM potassium phosphate-10, 75 mM sodium chloride-11, 5 mM DTT-12, 2 mM EDTA-13, 20 mM sodium phosphate-14, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2LNX Solution structure of Vav2 SH2 domain 提交 2012-01-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
659–771（113 aa）
片段：UNP RESIDUES 659-771
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] entity-1, 5 mM DTT-2, 75 mM sodium chloride-3, 5 mM potassium phosphate-4, 20 mM sodium phosphate-5, 1 mM EDTA-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] entity-7, 75 mM sodium chloride-8, 5 mM DTT-9, 5 mM potassium phosphate-10, 20 mM sodium phosphate-11, 1 mM EDTA-12, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4ROJ Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with TXNIP phosphorylated peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
667–782（116 aa）
片段：UNP residues 667-782
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG550-MME, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 4ROJ Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with TXNIP phosphorylated peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
667–782（116 aa）
片段：UNP residues 667-782
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG550-MME, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 4ROJ Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with TXNIP phosphorylated peptide 提交 2014-10-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
667–782（116 aa）
片段：UNP residues 667-782
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG550-MME, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 7RNV SH2 domain of guanine nucleotide exchange factor Vav2 in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
665–774（110 aa）
片段：SH2 domain (UNP residues 665-774)
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris hydrochloride, pH 8.5, 30% PEG4000
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分辨率 2.15 Å R-free 0.272 |
| 7WFY Crystal Structure of the VAV2 SH2 domain in complex with APP phosphorylated peptide 提交 2021-12-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
659–771（113 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；289 K；25% PEG 3350, 0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M, Tris/HCl, pH 8.4
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分辨率 2.45 Å R-free 0.268 |