当前蛋白身份:P53992 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3EH2 Crystal structure of the human COPII-coat protein Sec24c 提交 2008-09-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 329–1094(766 aa) 片段:conserved core, UNP residues 329-1094
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;300 K;CRYSTALS WERE GROWN VIA THE HANGING-DROP METHOD, BY ADDING 1UL PROTEIN SOLUTION TO 1UL OF WELL SOLUTION COMPRISING 6% (W/V) PEG 4000 AND 0.1 M MES., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.35 Å R-free 0.284
3EH2 Crystal structure of the human COPII-coat protein Sec24c 提交 2008-09-11 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 329–1094(766 aa) 片段:conserved core, UNP residues 329-1094
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;300 K;CRYSTALS WERE GROWN VIA THE HANGING-DROP METHOD, BY ADDING 1UL PROTEIN SOLUTION TO 1UL OF WELL SOLUTION COMPRISING 6% (W/V) PEG 4000 AND 0.1 M MES., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.35 Å R-free 0.284
3EH2 Crystal structure of the human COPII-coat protein Sec24c 提交 2008-09-11 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 329–1094(766 aa) 片段:conserved core, UNP residues 329-1094
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;300 K;CRYSTALS WERE GROWN VIA THE HANGING-DROP METHOD, BY ADDING 1UL PROTEIN SOLUTION TO 1UL OF WELL SOLUTION COMPRISING 6% (W/V) PEG 4000 AND 0.1 M MES., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.35 Å R-free 0.284
6PU1 Cysteine stabilized hexameric HIV-1 CA in complex with SEC24C peptide 提交 2019-07-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 228–242(15 aa)
未记录 IOD IODIDE ION × 18 CL CHLORIDE ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277.15 K;12% PEG3350, 24% glycerol, 0.35 M NaI, 50 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.28 Å R-free 0.272
8CL3 HIV-1 mature capsid hexamer from CA-IP6 CLPs, bound to Sec24C peptide. 提交 2023-02-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 B 228–242(15 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å