当前蛋白身份：P54030
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5COL RIBOSOMAL PROTEIN L11 FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–161（161 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM Sodium Citrate, pH 5.0, 0.1 M MgCl2, 27% PEG 600
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 5COL RIBOSOMAL PROTEIN L11 FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-07-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–161（161 aa）
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未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；100 mM Sodium Citrate, pH 5.0, 0.1 M MgCl2, 27% PEG 600
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 5D8H CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII WITH ANTIBIOTIC THIOSTREPTON 提交 2015-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–161（161 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 11 NA SODIUM ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 mM Tris-HCl, pH 7.5, 10% PEG 8000, 20% glycerol, 1 mM TCEP (tris(2-carboxyethyl)phosphine), 0.125 mM CTAB
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分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 5DAR CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-08-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–161（161 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 K POTASSIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 0.15 M KCl, 20 mM MgCl2, 15% PEG 4000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |
| 5DAR CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-08-20 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–161（161 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 0.15 M KCl, 20 mM MgCl2, 15% PEG 4000
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分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |