当前蛋白身份：P54252
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1YZB Solution structure of the Josephin domain of Ataxin-3 提交 2005-02-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
片段：N-terminal domain of Ataxin-3
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM of Josephin 15N, 13C; 20mM sodium phosphate buffer (pH 6.5); 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2AGA De-ubiquitinating function of ataxin-3: insights from the solution structure of the Josephin domain 提交 2005-07-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
片段：Josephin domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM KPO4；压力 1
NMR样品组成
2mM Josephin domain U-15N,13C; 20mM phosphate buffer pH 6.4; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2DOS Structural basis for the recognition of Lys48-linked polyubiquitin chain by the Josephin domain of ataxin-3, a putative deubiquitinating enzyme 提交 2006-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–171（171 aa）
片段：Josephin domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM Sodium phosphate buffer；压力 1
NMR样品组成
1.2mM Josephin domain U-15N,13C; 10mM Sodium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.2mM Josephin domain U-15N,13C; 10mM Sodium phosphate buffer; 99% D2O | 99% D2O
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分辨率未提供 |
| 2JRI Solution structure of the Josephin domain of Ataxin-3 in complex with ubiquitin molecule. 提交 2007-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
片段：N-terminal domain of ataxin-3 sequence database residues 1-182
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.01；压力 ambient
NMR样品组成
0.1 - 0.3 mM [U-15N] protein, 0.1 -0.3 mM [U-13C; U-15N] protein, 0.1-0.3 mM protein, 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2KLZ Solution Structure of the Tandem UIM Domain of Ataxin-3 Complexed with Ubiquitin 提交 2009-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
222–263（42 aa）
片段：UIM1 and UIM 2 domain, UNP residues 222-263
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] protein-1, 20 mM sodium phosphate-2, 100 mM sodium chloride-3, 0.02 % sodium azide-4, 4 mM ubiquitin-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-6, 20 mM sodium phosphate-7, 100 mM sodium chloride-8, 0.02 % sodium azide-9, 4 mM ubiquitin-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 4WTH Ataxin-3 Carboxy Terminal Region - Crystal C2 (triclinic) 提交 2014-10-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
278–324（47 aa）
片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG5000 MME, 0.9 M sodium acetate, 0.06 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate
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分辨率 2.25 Å R-free 0.250 |
| 4WTH Ataxin-3 Carboxy Terminal Region - Crystal C2 (triclinic) 提交 2014-10-30 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
278–324（47 aa）
片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG5000 MME, 0.9 M sodium acetate, 0.06 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.250 |
| 4YS9 Ataxin-3 Carboxy-Terminal Region - Crystal C1 (tetragonal) 提交 2015-03-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
278–324（47 aa）
片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；25% PEG5000 MME, 1.0 M sodium acetate, 0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate
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分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |