当前蛋白身份：P59595
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1SSK Structure of the N-terminal RNA-binding Domain of the SARS CoV Nucleocapsid Protein 提交 2004-03-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
45–181（137 aa）
片段：N-terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM Nacl；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM N-terminal SARS CoV NP, U-15N,90% H2O/10% 2H2O, 50 mM sodium phosphate (pH 6.8) and 100 mM sodium chloride.
|
分辨率未提供 |
| 1X7Q Crystal structure of HLA-A*1101 with sars nucleocapsid peptide 提交 2004-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
362–370（9 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；25% PEG 5000 MME, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.181 |
| 2CJR Crystal structure of oligomerization domain of SARS coronavirus nucleocapsid protein. 提交 2006-04-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
链 B
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.00
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 2CJR Crystal structure of oligomerization domain of SARS coronavirus nucleocapsid protein. 提交 2006-04-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
链 D
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.00
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 2CJR Crystal structure of oligomerization domain of SARS coronavirus nucleocapsid protein. 提交 2006-04-06 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
链 F
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.00
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 2CJR Crystal structure of oligomerization domain of SARS coronavirus nucleocapsid protein. 提交 2006-04-06 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
链 H
248–365（118 aa）
片段：RESIDUES 248-365
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.00
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 2GIB Crystal structure of the SARS coronavirus nucleocapsid protein dimerization domain 提交 2006-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
270–370（101 aa）
片段：dimerization domain (residues 270-370)
链 B
270–370（101 aa）
片段：dimerization domain (residues 270-370)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.5 K；30-33% Pentaerythritol ethoxylate 15/4 EO/OH, 50 mM Ammonium sulfate, 50 mM Bis-Tris , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.5K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 2GIB Crystal structure of the SARS coronavirus nucleocapsid protein dimerization domain 提交 2006-03-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
270–370（101 aa）
片段：dimerization domain (residues 270-370)
链 B
270–370（101 aa）
片段：dimerization domain (residues 270-370)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.5 K；30-33% Pentaerythritol ethoxylate 15/4 EO/OH, 50 mM Ammonium sulfate, 50 mM Bis-Tris , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.5K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 2GIB Crystal structure of the SARS coronavirus nucleocapsid protein dimerization domain 提交 2006-03-28 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
270–370（101 aa）
片段：dimerization domain (residues 270-370)
链 B
270–370（101 aa）
片段：dimerization domain (residues 270-370)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.5 K；30-33% Pentaerythritol ethoxylate 15/4 EO/OH, 50 mM Ammonium sulfate, 50 mM Bis-Tris , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.5K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 2JW8 Solution structure of stereo-array isotope labelled (SAIL) C-terminal dimerization domain of SARS coronavirus nucleocapsid protein 提交 2007-10-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
248–365（118 aa）
片段：UNP residues 248-365
链 B
248–365（118 aa）
片段：UNP residues 248-365
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.5mM SAIL-C-terminal dimerization domain of SARS coronavirus nucleocapsid protein, 10mM sodium phosphate, 50mM NaCl, 1mM EDTA, 1mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OFZ Ultrahigh Resolution Crystal Structure of RNA Binding Domain of SARS Nucleopcapsid (N Protein) at 1.1 Angstrom Resolution in Monoclinic Form. 提交 2007-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
49–174（126 aa）
片段：RNA BINDING DOMAIN OF SARS NUCLEOCAPSID
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；25% PEG 2000MME, 0.2 M sodium bromide, 0.1 M sodium acetate, bcip ADDITIVE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.191 |
| 2OG3 structure of the rna binding domain of n protein from SARS coronavirus in cubic crystal form 提交 2007-01-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
49–174（126 aa）
片段：rna binding domain of N protein
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；277 K；40% MPD and 0.1 M Tris pH 8.0, typically crystals appear within 2 weeks, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.247 |
| 3I6L Newly identified epitope N1 derived from SARS-CoV N protein complexed with HLA-A*2402 提交 2009-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
346–354（9 aa）
片段：UNP residue 346-354
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.9, 25% w/v Polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.284 |
| 7LG0 Human leukocyte antigen B*07:02 in complex with SARS-CoV2 epitope SPRWYFYYL 提交 2021-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
106–114（9 aa）
片段：UNP residues 105-113
|
未记录 | P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；290 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.5, 2 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |