当前蛋白身份：P60785
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3CB4 The Crystal Structure of LepA 提交 2008-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；100 mM Tris-HCl pH 8.0
10% Peg 2000MME, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3CB4 The Crystal Structure of LepA 提交 2008-02-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；100 mM Tris-HCl pH 8.0
10% Peg 2000MME, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3CB4 The Crystal Structure of LepA 提交 2008-02-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；100 mM Tris-HCl pH 8.0
10% Peg 2000MME, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3CB4 The Crystal Structure of LepA 提交 2008-02-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；100 mM Tris-HCl pH 8.0
10% Peg 2000MME, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3CB4 The Crystal Structure of LepA 提交 2008-02-21 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；100 mM Tris-HCl pH 8.0
10% Peg 2000MME, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3CB4 The Crystal Structure of LepA 提交 2008-02-21 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；100 mM Tris-HCl pH 8.0
10% Peg 2000MME, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3DEG Complex of elongating Escherichia coli 70S ribosome and EF4(LepA)-GMPPNP 提交 2008-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–545（545 aa）
片段：EF4
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM HEPES-KOH (pH 7.6), 4.5 mM Mg(CH3COO)2, 150 mM NH4CH3COO, 4 mM B-mercaptoethanol, 2 mM spermidine, and 0.05 mM spermine
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 10.90 Å |
| 3JCD Structure of Escherichia coli EF4 in posttranslocational ribosomes (Post EF4) 提交 2015-12-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 x
1–599（599 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 3JCE Structure of Escherichia coli EF4 in pretranslocational ribosomes (Pre EF4) 提交 2015-12-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 x
1–599（599 aa）
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未记录 | PHE PHENYLALANINE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |