当前蛋白身份：P60880
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1KIL Three-dimensional structure of the complexin/SNARE complex 提交 2001-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
10–81（72 aa）
片段：SNARE motif (11-82)
链 D
139–204（66 aa）
片段：SNARE motif (141-203)
|
突变：W added at C-terminus 突变：W added at C-terminus | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；27%(v/v) Iso-Propanol, 200mM MgCl2, 100mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.305 |
| 1XTG Crystal structure of NEUROTOXIN BONT/A complexed with Synaptosomal-associated protein 25 提交 2004-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
146–204（59 aa）
片段：n2 domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；10% PEG 8000, 200 mM magnesium acetate, 100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature
4K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 2N1T Dynamic binding mode of a synaptotagmin-1-SNARE complex in solution 提交 2015-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
7–83（77 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 7-83)
链 D
131–204（74 aa）
片段：C-terminal domain (UNP residues 131-204)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
30 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM Tris-HCl, 125 mM KSCN, 1 mM CaCl2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3DDA Crystal structure of the catalytic domain of Botulinum neurotoxin serotype a with a snap-25 peptide 提交 2008-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
197–202（6 aa）
片段：sequence database residues 197-202
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% PEG8000, 0.2M Ammoium Sulfate, 0.1M Sodium Cacodylate, 5% Ethylene Glycol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.200 |
| 3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 D
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 H
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 3RK3 Truncated SNARE complex with complexin 提交 2011-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 D
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.316 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 D
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 H
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 L
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 O
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 P
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 S
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 T
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 W
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 X
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 a
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 b
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 e
7–82（76 aa）
片段：UNP residues 7-82
链 f
141–203（63 aa）
片段：UNP residues 141-203
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3ZUR Crystal structure of an engineered botulinum neurotoxin type A- SNARE23 derivative, LC0-A-SNAP25-Hn-A 提交 2011-07-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
145–206（62 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 3-431, SNAP25, RESIDUES 145-206, TRANSLOCATION DOMAIN RESIDUES, 454-865
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1 M TRIS PH 7.5, 0.2 M LISO4, 15% PEG 3350.
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.266 |
| 3ZUR Crystal structure of an engineered botulinum neurotoxin type A- SNARE23 derivative, LC0-A-SNAP25-Hn-A 提交 2011-07-19 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
145–206（62 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 3-431, SNAP25, RESIDUES 145-206, TRANSLOCATION DOMAIN RESIDUES, 454-865
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1 M TRIS PH 7.5, 0.2 M LISO4, 15% PEG 3350.
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.266 |
| 6JLH Structure of SCGN in complex with a Snap25 peptide 提交 2019-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
154–170（17 aa）
链 D
154–170（17 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 12 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M glycocine, 0.1 M Tris Bicine pH 8.5, 12.5% MPD, 12.5% PEG 1000, 12.5% PEG 3350
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.237 |
| 8BAN Secretagogin (mouse) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
155–179（25 aa）
|
突变：F64L,Q80R,I167T MUTATIONS IN ENHANCED GFP (HIGHER FLUORESCENCE INTENSITY) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；PEG 3350 (20%), 2 mM CaCl2, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 0.2 M NaI
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 8BAN Secretagogin (mouse) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-11 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
155–179（25 aa）
|
突变：F64L,Q80R,I167T MUTATIONS IN ENHANCED GFP (HIGHER FLUORESCENCE INTENSITY) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；PEG 3350 (20%), 2 mM CaCl2, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 0.2 M NaI
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 8BAV Secretagogin (human) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
155–179（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Na-acetate
20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 8BAV Secretagogin (human) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-12 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
155–179（25 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Na-acetate
20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |