当前蛋白身份:P62068 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5CVM USP46~ubiquitin BEA covalent complex 提交 2015-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–366(342 aa) 片段:UNP residues 25-366
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;3.6 M sodium formate
分辨率 1.90 Å R-free 0.197
5CVN WDR48 (2-580):USP46~ubiquitin ternary complex 提交 2015-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 25–366(342 aa) 片段:UNP residues 25-366
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.8;292 K;0.1 M sodium chloride, 5% ethanol, 15% MPD, 0.1 M Tris pH 8.8
分辨率 3.36 Å R-free 0.222
5CVO WDR48:USP46~ubiquitin ternary complex 提交 2015-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 25–366(342 aa) 片段:UNP residues 25-366
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;292 K;15% MPD, 0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.0
分辨率 3.88 Å R-free 0.275
5CVO WDR48:USP46~ubiquitin ternary complex 提交 2015-07-27 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 25–366(342 aa) 片段:UNP residues 25-366
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;292 K;15% MPD, 0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.0
分辨率 3.88 Å R-free 0.275
5L8H Structure of USP46-UbVME 提交 2016-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 8–366(359 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.96M Sodium Citrate pH7.5 and 0.1mM zinc chloride Cryo - 20% Glycerol
分辨率 1.85 Å R-free 0.194
6JLQ Crystal structure of human USP46-WDR48-WDR20 complex 提交 2019-03-06 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 24–366(343 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;1.0M Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic, pH 7.2
分辨率 3.10 Å R-free 0.272