当前蛋白身份：P63027
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3FIE Crystal structure of Clostridium botulinum neurotoxin serotype F catalytic domain with an inhibitor (inh1) 提交 2008-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
22–58（37 aa）
片段：residues 22-58
|
突变：Q58DCY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.279 |
| 3FIE Crystal structure of Clostridium botulinum neurotoxin serotype F catalytic domain with an inhibitor (inh1) 提交 2008-12-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
22–58（37 aa）
片段：residues 22-58
|
突变：Q58DCY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.279 |
| 3FII Crystal structure of Clostridium botulinum neurotoxin serotype F catalytic domain with an inhibitor (inh2) 提交 2008-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
22–53（32 aa）
片段：residues 27-58
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突变：Q58DCY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.290 |
| 3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
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未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 3RK3 Truncated SNARE complex with complexin 提交 2011-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.316 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 M
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 Q
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 U
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 Y
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 c
28–60（33 aa）
片段：UNP residues 28-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.345 |
| 7UDC cryo-EM structures of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class1 提交 2022-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
29–83（55 aa）
|
突变：Q36C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9CKX Crystal structure of Dsk2 Sti1 domain bound to a transmembrane domain 提交 2024-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
95–114（20 aa）
链 B
95–114（20 aa）
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突变：I98A,I102A,I106A,I108A,I110A,I111A (Uniprot Vamp2 numbering) in the Vamp2 segment 突变：I98A,I102A,I106A,I108A,I110A,I111A (Uniprot Vamp2 numbering) in the Vamp2 segment | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；2.5% MPD, 100 mM Tris pH 8.5
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.232 |