当前蛋白身份:P63241 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3CPF Crystal structure of human eukaryotic translation initiation factor EIF5A 提交 2008-03-31 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 15–151(137 aa) 片段:Residues 15-151
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291 K;22% PEG 3350, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium cacodylate. Cryoprotected with 20% PEG 3350 and 20% Ethylene glycol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.300
3CPF Crystal structure of human eukaryotic translation initiation factor EIF5A 提交 2008-03-31 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 15–151(137 aa) 片段:Residues 15-151
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291 K;22% PEG 3350, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium cacodylate. Cryoprotected with 20% PEG 3350 and 20% Ethylene glycol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.300
5DLQ Crystal structure of RanGTP-Exportin 4-eIF5A complex 提交 2015-09-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 45–184(140 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES, DTT
分辨率 3.20 Å R-free 0.270
5DLQ Crystal structure of RanGTP-Exportin 4-eIF5A complex 提交 2015-09-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 45–184(140 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES, DTT
分辨率 3.20 Å R-free 0.270
8Y0W dormant ribosome with eIF5A, eEF2 and SERBP1 提交 2024-01-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:81-meric(81) 与全部聚合物一致
链 5 1–154(154 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 226 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50mM HEPES, pH7.5, 100mM KOAc, 5mM Mg(OAc)2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å