当前蛋白身份:P63241
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3CPF Crystal structure of human eukaryotic translation initiation factor EIF5A 提交 2008-03-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
15–151(137 aa)
片段:Residues 15-151
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291 K;22% PEG 3350, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium cacodylate. Cryoprotected with 20% PEG 3350 and 20% Ethylene glycol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.300 |
| 3CPF Crystal structure of human eukaryotic translation initiation factor EIF5A 提交 2008-03-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
15–151(137 aa)
片段:Residues 15-151
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291 K;22% PEG 3350, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium cacodylate. Cryoprotected with 20% PEG 3350 and 20% Ethylene glycol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.300 |
| 5DLQ Crystal structure of RanGTP-Exportin 4-eIF5A complex 提交 2015-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
45–184(140 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES, DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.270 |
| 5DLQ Crystal structure of RanGTP-Exportin 4-eIF5A complex 提交 2015-09-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
45–184(140 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.26;293 K;Peg 400, MES, DTT
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.270 |
| 8Y0W dormant ribosome with eIF5A, eEF2 and SERBP1 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:81-meric(81) 与全部聚合物一致 |
链 5
1–154(154 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 226 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50mM HEPES, pH7.5, 100mM KOAc, 5mM Mg(OAc)2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |