当前蛋白身份:P64604 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8HPZ Crystal structure of the MlaD domain of the MlaD protein from Escherichia coli (Form I) 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 29–183(155 aa)
链 B 29–183(155 aa)
链 C 29–183(155 aa)
未记录 CO2 CARBON DIOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 5;293 K;1.8 M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH 5.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.273
8HQ9 Crystal structure of the MlaD domain of the MlaD protein from Escherichia coli (Form II) 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 29–183(155 aa)
链 B 29–183(155 aa)
链 C 29–183(155 aa)
链 D 29–183(155 aa)
链 E 29–183(155 aa)
链 F 29–183(155 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 CO2 CARBON DIOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 5;293 K;0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihyrate pH 5.0, 10% (w/v) PEG 20000
分辨率 2.70 Å R-free 0.261
8HQA Crystal structure of the ectodomain of the MlaD protein from Escherichia coli in the resting state 提交 2022-12-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 29–183(155 aa)
链 B 29–183(155 aa)
链 C 29–183(155 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 8.5;293 K;0.01 M nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M tris pH 8.5, 20% (w/v) PEG monoethyl ether 2000
分辨率 3.20 Å R-free 0.275
8OJ4 Structure of the MlaCD complex (1:6 stoichiometry) 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 1–183(183 aa)
链 B 1–183(183 aa)
链 C 1–183(183 aa)
链 D 1–183(183 aa)
链 E 1–183(183 aa)
链 F 1–183(183 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.35 Å
8OJG Structure of the MlaCD complex (2:6 stoichiometry) 提交 2023-03-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–183(183 aa)
链 B 1–183(183 aa)
链 C 1–183(183 aa)
链 D 1–183(183 aa)
链 E 1–183(183 aa)
链 F 1–183(183 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.38 Å