当前蛋白身份：P68133
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7RNS nSH2 domain of p85-alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
52–60（9 aa）
片段：UNP residues 52-60
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.05 M cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 1.0 M sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.147 |
| 7RNU nSH2 domain of p85-beta subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
52–60（9 aa）
片段：UNP residues 52-60
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；25% w/v PEG1500, 100 mM MIB, pH 5.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.222 |
| 7RNU nSH2 domain of p85-beta subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
52–60（9 aa）
片段：UNP residues 52-60
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；25% w/v PEG1500, 100 mM MIB, pH 5.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.222 |
| 7RNU nSH2 domain of p85-beta subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
52–60（9 aa）
片段：UNP residues 52-60
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；25% w/v PEG1500, 100 mM MIB, pH 5.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.222 |
| 7RNU nSH2 domain of p85-beta subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
52–60（9 aa）
片段：UNP residues 52-60
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；25% w/v PEG1500, 100 mM MIB, pH 5.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.222 |
| 7RNV SH2 domain of guanine nucleotide exchange factor Vav2 in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
52–60（9 aa）
片段：UNP residues 52-60
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris hydrochloride, pH 8.5, 30% PEG4000
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分辨率 2.15 Å R-free 0.272 |
| 9DUU Cryo-EM structure of recombinant wildtype ACTA1 phalloidin-stabilized F-actin 提交 2024-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
链 E
3–377（375 aa）
链 F
3–377（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；25 mM KCl, 2 mM EGTA, 60 mM MOPS (pH7), 1 mM DTT, and 4 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |
| 9DUV Cryo-EM structure of recombinant R254H ACTA1 phalloidin-stabilized F-actin 提交 2024-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
3–377（375 aa）
链 B
3–377（375 aa）
链 C
3–377（375 aa）
链 D
3–377（375 aa）
链 E
3–377（375 aa）
链 F
3–377（375 aa）
|
突变：R254H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R254H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R254H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R254H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R254H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R254H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；25 mM KCl, 2 mM EGTA, 60 mM MOPS (pH7), 1 mM DTT, and 4 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |