当前蛋白身份:P69332
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4XT1 Structure of a nanobody-bound viral GPCR bound to human chemokine CX3CL1 提交 2015-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–354(354 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 UNL UNKNOWN LIGAND × 7 SIN SUCCINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.3;293 K;PEG 300, MES, sodium succinate, polypropylene glycol 400
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.249 |
| 4XT3 Structure of a viral GPCR bound to human chemokine CX3CL1 提交 2015-01-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–354(354 aa)
|
未记录 | UNL UNKNOWN LIGAND × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.4;293 K;PEG 300, HEPES, ammonium phosphate
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.322 |
| 7RKF Structure of CX3CL1-US28-G11iN18-scFv16 in TL-state 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
1–354(354 aa)
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未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;1 s blotting before plunging
|
分辨率 4.00 Å |
| 7RKM Structure of CX3CL1-US28-Gi-scFv16 in C-state 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
1–354(354 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;1 s blotting before plunging
|
分辨率 3.50 Å |
| 7RKN Structure of CX3CL1-US28-Gi-scFv16 in OC-state 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
1–354(354 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;1 s blotting before plunging
|
分辨率 3.60 Å |