当前蛋白身份:P69332 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4XT1 Structure of a nanobody-bound viral GPCR bound to human chemokine CX3CL1 提交 2015-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–354(354 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 UNL UNKNOWN LIGAND × 7 SIN SUCCINIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.3;293 K;PEG 300, MES, sodium succinate, polypropylene glycol 400
分辨率 2.89 Å R-free 0.249
4XT3 Structure of a viral GPCR bound to human chemokine CX3CL1 提交 2015-01-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–354(354 aa)
未记录 UNL UNKNOWN LIGAND × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.4;293 K;PEG 300, HEPES, ammonium phosphate
分辨率 3.80 Å R-free 0.322
7RKF Structure of CX3CL1-US28-G11iN18-scFv16 in TL-state 提交 2021-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–354(354 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;1 s blotting before plunging
分辨率 4.00 Å
7RKM Structure of CX3CL1-US28-Gi-scFv16 in C-state 提交 2021-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–354(354 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;1 s blotting before plunging
分辨率 3.50 Å
7RKN Structure of CX3CL1-US28-Gi-scFv16 in OC-state 提交 2021-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–354(354 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;1 s blotting before plunging
分辨率 3.60 Å