当前蛋白身份：P70206
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3RYT The Plexin A1 intracellular region in complex with Rac1 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1269–1894（626 aa）
片段：intracellular region (UNP residues 1269-1894)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；15% PEG1500, 100 mM SPG buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.340 |
| 3RYT The Plexin A1 intracellular region in complex with Rac1 提交 2011-05-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1269–1894（626 aa）
片段：intracellular region (UNP residues 1269-1894)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；15% PEG1500, 100 mM SPG buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.340 |
| 5L56 Plexin A1 full extracellular region, domains 1 to 10, to 4 angstrom 提交 2016-05-28 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
37–1236（1200 aa）
片段：UNP residues 37-1236
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.5 K；6% (w/v) PEG 4k,
5 mM tricine or 5 mM TRIS
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.308 |
| 5L59 Plexin A1 full extracellular region, domains 1 to 10, to 6 angstrom, spacegroup P2(1) 提交 2016-05-28 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–1236（1200 aa）
片段：UNP residues 37-1236
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；15% (v/v) propanol,
20 mM magnesium chloride
50 mM MES, pH 6.0
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.299 |
| 5L59 Plexin A1 full extracellular region, domains 1 to 10, to 6 angstrom, spacegroup P2(1) 提交 2016-05-28 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
37–1236（1200 aa）
片段：UNP residues 37-1236
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；15% (v/v) propanol,
20 mM magnesium chloride
50 mM MES, pH 6.0
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.299 |
| 5L5C Plexin A1 full extracellular region, domains 1 to 10, to 6 angstrom, spacegroup P4(3)2(1)2 提交 2016-05-28 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
37–1236（1200 aa）
片段：UNP residues 37-1236
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.5 K；6% (w/v) PEG 4k,
5 mM tricine, pH 8.5
|
分辨率 6.00 Å R-free 0.316 |
| 5L7N Plexin A1 extracellular fragment, domains 7-10 (IPT3-IPT6) 提交 2016-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
861–1241（381 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.5 K；25% (w/v) polyethylene glycol 3,350, 100mM BIS-TRIS pH 5.5 and 200mM potassium sodium tartrate
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分辨率 2.20 Å R-free 0.270 |