当前蛋白身份：P71814
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2PMU Crystal structure of the DNA-binding domain of PhoP 提交 2007-04-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
144–247（104 aa）
片段：DNA-binding domain, residues 144-247
链 B
144–247（104 aa）
片段：DNA-binding domain, residues 144-247
链 C
144–247（104 aa）
片段：DNA-binding domain, residues 144-247
链 D
144–247（104 aa）
片段：DNA-binding domain, residues 144-247
链 E
144–247（104 aa）
片段：DNA-binding domain, residues 144-247
链 F
144–247（104 aa）
片段：DNA-binding domain, residues 144-247
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 K POTASSIUM ION × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 CL CHLORIDE ION × 4 GLY GLYCINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；1.4 M Na/K phosphate, pH 5.6, 100 mM glycine, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.238 |
| 3R0J Structure of PhoP from Mycobacterium tuberculosis 提交 2011-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–247（247 aa）
链 B
1–247（247 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 5 PGR R-1,2-PROPANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 1.8 M ammonium sulfate, 1.5% PEG 400, 12% 1.2-propanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.245 |
| 9KET Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules(composite map) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–247（247 aa）
链 K
1–247（247 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 9KEU Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric（12） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–247（247 aa）
链 J
1–247（247 aa）
链 K
1–247（247 aa）
链 M
1–247（247 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9KEV Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric（15） 待复核 |
链 J
1–247（247 aa）
链 K
1–247（247 aa）
链 L
1–247（247 aa）
链 M
1–247（247 aa）
链 N
1–247（247 aa）
链 O
1–247（247 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.31 Å |