当前蛋白身份:P78344 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3D3M The Crystal Structure of the C-terminal region of Death Associated Protein 5(DAP5) 提交 2008-05-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 730–897(168 aa) 片段:C terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under oil;pH 6;293 K;100mM MMT (D,L Maleic acid, MES and Tris) pH=6, and 20% PEG 1,500, Microbatch under oil, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.259
3D3M The Crystal Structure of the C-terminal region of Death Associated Protein 5(DAP5) 提交 2008-05-12 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 730–897(168 aa) 片段:C terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under oil;pH 6;293 K;100mM MMT (D,L Maleic acid, MES and Tris) pH=6, and 20% PEG 1,500, Microbatch under oil, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.259
3L6A Crystal structure of the C-terminal region of Human p97 提交 2009-12-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 540–897(358 aa) 片段:C-terminal region, UNP residues 540-897
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;289 K;2.1M (NH4)2SO4, 0.1M MES pH 6.0, 2% PEG MME 550, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
4IUL MIF4G domain of DAP5 提交 2013-01-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 61–323(263 aa) 片段:MIF4G domain, UNP residues 61-323
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulfate and 18 20% (w/v) polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.256
4IUL MIF4G domain of DAP5 提交 2013-01-21 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 61–323(263 aa) 片段:MIF4G domain, UNP residues 61-323
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulfate and 18 20% (w/v) polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.256
4IUL MIF4G domain of DAP5 提交 2013-01-21 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 61–323(263 aa) 片段:MIF4G domain, UNP residues 61-323
链 B 61–323(263 aa) 片段:MIF4G domain, UNP residues 61-323
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulfate and 18 20% (w/v) polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.256
9JJ7 The crystal structure of SARS-CoV-2 NSP5 in complex with eIF4G2 提交 2024-09-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 446–455(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;0.1 M MES pH 5.6, 7% PEG 6000, and 6% dimethyl sulfoxide (DMSO)
分辨率 1.80 Å R-free 0.212