当前蛋白身份：P80386
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Z0M the glycogen-binding domain of the AMP-activated protein kinase beta1 subunit 提交 2005-03-02 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
67–162（96 aa）
片段：68-163 of beta1 subunit
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；PEG, monomethyl ether 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.243 |
| 1Z0M the glycogen-binding domain of the AMP-activated protein kinase beta1 subunit 提交 2005-03-02 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
67–162（96 aa）
片段：68-163 of beta1 subunit
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；PEG, monomethyl ether 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.243 |
| 1Z0M the glycogen-binding domain of the AMP-activated protein kinase beta1 subunit 提交 2005-03-02 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
67–162（96 aa）
片段：68-163 of beta1 subunit
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；PEG, monomethyl ether 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.243 |
| 1Z0N the glycogen-binding domain of the AMP-activated protein kinase 提交 2005-03-02 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
67–162（96 aa）
片段：68-163 fragment
|
突变：L105M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；PEG, monomethyl ether 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.213 |
| 1Z0N the glycogen-binding domain of the AMP-activated protein kinase 提交 2005-03-02 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
67–162（96 aa）
片段：68-163 fragment
|
突变：L105M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；PEG, monomethyl ether 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.213 |
| 1Z0N the glycogen-binding domain of the AMP-activated protein kinase 提交 2005-03-02 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
67–162（96 aa）
片段：68-163 fragment
|
突变：L105M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；PEG, monomethyl ether 5000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.213 |
| 4EAG Co-crystal structure of an chimeric AMPK core with ATP 提交 2012-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
187–270（84 aa）
片段：UNP residues 187-270
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.02；298 K；MES, 12% Methanol, 2% 1,4-butanodiol, pH 6.02 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.252 |
| 4EAK Co-crystal structure of an AMPK core with ATP 提交 2012-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
200–270（71 aa）
片段：UNP residues 200-270
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.1M MES pH 5.9, 18% IPP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298 K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.254 |
| 4EAL Co-crystal of AMPK core with ATP soaked with AMP 提交 2012-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
200–270（71 aa）
片段：UNP residues 200-270
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；298 K；0.1M MES pH5.9, 18% IPP, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.277 |
| 4QFG Structure of AMPK in complex with STAUROSPORINE inhibitor and in the absence of a synthetic activator 提交 2014-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
67–269（203 aa）
片段：AMPK beta1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.46 Å R-free 0.267 |
| 4QFG Structure of AMPK in complex with STAUROSPORINE inhibitor and in the absence of a synthetic activator 提交 2014-05-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
67–269（203 aa）
片段：AMPK beta1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 2 CL CHLORIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 6 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.46 Å R-free 0.267 |
| 4QFR Structure of AMPK in complex with Cl-A769662 activator and STAUROSPORINE inhibitor 提交 2014-05-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
片段：AMPK beta 1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 1 CL CHLORIDE ION × 5 32J 2-chloro-4-hydroxy-3-(2'-hydroxybiphenyl-4-yl)-6-oxo-6,7-dihydrothieno[2,3-b]pyridine-5-carbonitrile × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.34 Å R-free 0.249 |
| 4QFR Structure of AMPK in complex with Cl-A769662 activator and STAUROSPORINE inhibitor 提交 2014-05-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
片段：AMPK beta 1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 2 CL CHLORIDE ION × 10 32J 2-chloro-4-hydroxy-3-(2'-hydroxybiphenyl-4-yl)-6-oxo-6,7-dihydrothieno[2,3-b]pyridine-5-carbonitrile × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.34 Å R-free 0.249 |
| 4QFR Structure of AMPK in complex with Cl-A769662 activator and STAUROSPORINE inhibitor 提交 2014-05-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
片段：AMPK beta 1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 2 CL CHLORIDE ION × 10 32J 2-chloro-4-hydroxy-3-(2'-hydroxybiphenyl-4-yl)-6-oxo-6,7-dihydrothieno[2,3-b]pyridine-5-carbonitrile × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.34 Å R-free 0.249 |
| 4QFS Structure of AMPK in complex with Br2-A769662core activator and STAUROSPORINE inhibitor 提交 2014-05-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
片段：AMPK beta 1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 1 32H 2-bromo-3-(4-bromophenyl)-4-hydroxy-6-oxo-6,7-dihydrothieno[2,3-b]pyridine-5-carbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 5 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.55 Å R-free 0.269 |
| 4QFS Structure of AMPK in complex with Br2-A769662core activator and STAUROSPORINE inhibitor 提交 2014-05-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
片段：AMPK beta 1
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 2 32H 2-bromo-3-(4-bromophenyl)-4-hydroxy-6-oxo-6,7-dihydrothieno[2,3-b]pyridine-5-carbonitrile × 2 CL CHLORIDE ION × 10 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；750 mM Ammonium Sulfate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM tri-Sodium Citrate, 1% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.55 Å R-free 0.269 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 5 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 6 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 4YEF beta1 carbohydrate binding module (CBM) of AMP-activated protein kinase (AMPK) in complex with glucosyl-beta-cyclododextrin 提交 2015-02-24 | Assembly 7 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
76–156（81 aa）
片段：UNP residues 76-156
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；281.15 K；0.2 M lithium sulphate, 25 % w/v PEG 8000 and 0.1 M sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.213 |
| 5KQ5 AMPK bound to allosteric activator 提交 2016-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
片段：residues 68-270
|
突变：S108D | STU STAUROSPORINE × 1 6VT 6-chloranyl-5-[4-(1-oxidanylcyclobutyl)phenyl]-1~{H}-indole-3-carboxylic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；~750 mM Ammonium Acetate, 500 mM Lithium Sulfate, 100 mM trisodium citrate, 1% ethylene glycol
|
分辨率 3.41 Å R-free 0.259 |
| 5T5T AMPK bound to allosteric activator 提交 2016-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
突变：S108D, Q109H | STU STAUROSPORINE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 75O 6-chloro-5-[6-(dimethylamino)-2-methoxypyridin-3-yl]-1H-indole-3-carboxylic acid × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；100 mM trisodium citrate, 500 mM ammonium sulfate, 900 mM lithium sulfate, and 4% glycerol
|
分辨率 3.46 Å R-free 0.231 |
| 5T5T AMPK bound to allosteric activator 提交 2016-08-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
突变：S108D, Q109H | STU STAUROSPORINE × 2 CL CHLORIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 4 75O 6-chloro-5-[6-(dimethylamino)-2-methoxypyridin-3-yl]-1H-indole-3-carboxylic acid × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；100 mM trisodium citrate, 500 mM ammonium sulfate, 900 mM lithium sulfate, and 4% glycerol
|
分辨率 3.46 Å R-free 0.231 |
| 5UFU Structure of AMPK bound to activator 提交 2017-01-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
未记录 | STU STAUROSPORINE × 1 85V 1,4:3,6-dianhydro-2-O-(6-chloro-5-{4-[1-(hydroxymethyl)cyclopropyl]phenyl}-1H-benzimidazol-2-yl)-D-mannitol × 1 CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 mM ammonium sulfate
500 mM lithium sulfate
100 mM trisodium citrate
1% ethylene glycol
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.238 |
| 5UFU Structure of AMPK bound to activator 提交 2017-01-05 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
未记录 | STU STAUROSPORINE × 2 85V 1,4:3,6-dianhydro-2-O-(6-chloro-5-{4-[1-(hydroxymethyl)cyclopropyl]phenyl}-1H-benzimidazol-2-yl)-D-mannitol × 2 CL CHLORIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 mM ammonium sulfate
500 mM lithium sulfate
100 mM trisodium citrate
1% ethylene glycol
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.238 |
| 6E4T Structure of AMPK bound to activator 提交 2018-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HTV 1-O-{6-chloro-5-[4-(1-hydroxycyclobutyl)phenyl]-1H-indole-3-carbonyl}-beta-D-glucopyranuronic acid × 1 STU STAUROSPORINE × 1 CL CHLORIDE ION × 5 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 MM AMMONIUM SULFATE, 500 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM TRISODIUM CITRATE, 1% ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.245 |
| 6E4T Structure of AMPK bound to activator 提交 2018-07-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HTV 1-O-{6-chloro-5-[4-(1-hydroxycyclobutyl)phenyl]-1H-indole-3-carbonyl}-beta-D-glucopyranuronic acid × 2 STU STAUROSPORINE × 2 CL CHLORIDE ION × 10 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 MM AMMONIUM SULFATE, 500 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM TRISODIUM CITRATE, 1% ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.245 |
| 6E4U Structure of AMPK bound to activator 提交 2018-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 HU7 1-O-{6-chloro-5-[6-(dimethylamino)-2-methoxypyridin-3-yl]-1H-indole-3-carbonyl}-beta-D-glucopyranuronic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 MM AMMONIUM SULFATE, 500 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM TRISODIUM CITRATE, 1% ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 3.27 Å R-free 0.231 |
| 6E4U Structure of AMPK bound to activator 提交 2018-07-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 2 HU7 1-O-{6-chloro-5-[6-(dimethylamino)-2-methoxypyridin-3-yl]-1H-indole-3-carbonyl}-beta-D-glucopyranuronic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 8 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 MM AMMONIUM SULFATE, 500 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM TRISODIUM CITRATE, 1% ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 3.27 Å R-free 0.231 |
| 6E4W Structure of AMPK bound to activator 提交 2018-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 1 HUG 1-O-(4,6-difluoro-5-{4-[(2S)-oxan-2-yl]phenyl}-1H-indole-3-carbonyl)-beta-D-glucopyranuronic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 3 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 MM AMMONIUM SULFATE, 500 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM TRISODIUM CITRATE, 1% ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.244 |
| 6E4W Structure of AMPK bound to activator 提交 2018-07-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
68–270（203 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | STU STAUROSPORINE × 2 HUG 1-O-(4,6-difluoro-5-{4-[(2S)-oxan-2-yl]phenyl}-1H-indole-3-carbonyl)-beta-D-glucopyranuronic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 6 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；750 MM AMMONIUM SULFATE, 500 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM TRISODIUM CITRATE, 1% ETHYLENE GLYCOL
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分辨率 3.35 Å R-free 0.244 |