当前蛋白身份:P82409 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1HA9 SOLUTION STRUCTURE OF THE SQUASH TRYPSIN INHIBITOR MCoTI-II, NMR, 30 STRUCTURES. 提交 2001-04-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–34(34 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3.4;290 K;压力 1
NMR测量条件 305 K
NMR样品组成 2.5MM MCOTI-II
分辨率未提供
1IB9 SOLUTION STRUCTURE OF MCOTI-II, A MACROCYCLIC TRYPSIN INHIBITOR 提交 2001-03-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–34(34 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3.5;293 K;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM MCoTI-II, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2C4B Inhibitor cystine knot protein McoEeTI fused to the catalytically inactive barnase mutant H102A 提交 2005-10-18 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–21(16 aa)
突变:YES 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 FMT FORMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 7 UNX UNKNOWN LIGAND × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;1.3 M AMMONIUM SULPHATE, 7% PEG400 (V/V), 0.1 M MES PH 6.5 AS RESERVOIR SOLUTION. DROPLETS MIXED FROM 8 UL PROTEIN (30 MG/ML) AND 4 UL RESERVOIR. SITTING DROP VAPOR DIFFUSION. 4 DEG. C.
分辨率 1.30 Å R-free 0.164
2C4B Inhibitor cystine knot protein McoEeTI fused to the catalytically inactive barnase mutant H102A 提交 2005-10-18 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 6–21(16 aa)
突变:YES 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FMT FORMIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 10 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;1.3 M AMMONIUM SULPHATE, 7% PEG400 (V/V), 0.1 M MES PH 6.5 AS RESERVOIR SOLUTION. DROPLETS MIXED FROM 8 UL PROTEIN (30 MG/ML) AND 4 UL RESERVOIR. SITTING DROP VAPOR DIFFUSION. 4 DEG. C.
分辨率 1.30 Å R-free 0.164
2IT8 Solution structure of a linear analog of the cyclic squash trypsin inhibitor MCoTI-II 提交 2006-10-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–34(29 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3;285 K;压力 1
NMR测量条件 pH 3;300 K;压力 1
NMR样品组成 1.2 mM peptide, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.2 mM peptide, D2O | D2O
分辨率未提供
2PO8 The structure of a two-disulfide intermediate of MCoTI-II 提交 2007-04-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 8–34(27 aa)
链 A 1–7(7 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 2;298 K;压力 atmospheric
NMR样品组成 0.6 mM peptide, 0.1% TFA, pH 2, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4GUX Crystal structure of trypsin:MCoTi-II complex 提交 2012-08-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–34(34 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;28% PEG3350, 0.24M ammonium acetate, 0.1M BisTris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.194
4GUX Crystal structure of trypsin:MCoTi-II complex 提交 2012-08-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 1–34(34 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;28% PEG3350, 0.24M ammonium acetate, 0.1M BisTris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.194
4GUX Crystal structure of trypsin:MCoTi-II complex 提交 2012-08-30 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 1–34(34 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;28% PEG3350, 0.24M ammonium acetate, 0.1M BisTris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.194